However, these prior simulations did not show that these striatal valuation signals translate to effects on actual choice (action selection). The reason for this is that there is no visual object recognition system in the network and hence it is not possible for the network to separately encode two stimuli presented in parallel (as any number of units presented in the input layer would be interpreted as one representation). Therefore the task is simulated by presenting a single stimulus (made up of four units), and differentially reinforcing responses. The task is simulated such that stimulus S1 is presented, R1 is positively rewarded on 80% of trials and R2 is associated with negative feedback on these trials. So choice of R1 can result from both Go S1-R1 and/or from NoGo S1-R2. For this reason, we simply recorded the Go/NoGo associations directly to show that DA depletion is associated with sronger NoGo S1-R2 and DA elevations with stronger Go S1-R2, etc. However, it is important to demonstrate that these can directly affect choice. These simulations also allow us to investigate separable effects of dopamine manipulations on learning (modulations of dopamine during acquisition of reinforcement contingencies) vs. the expression of learning (decision making after learning has occurred).
Here, we simulate the same task in a four response network (parameters of the network are different than for the two response network in order to accommodate the different architecture etc). The procedure is as follows. When S1 is presented, the model selects between R1 and R2 (these responses are provided with some bias in the cortical activity to ensure that R3 and R4 are not considered as 'candidates'). S1-R1 is rewarded on 80% of trials and S1-R2 is punished (DA dip) on 80% of trials (as in the 2-response network). Conversely, when S2 is presented, the model selects between R3 and R4, with R3 rewarded on 60% of trials. After this learning phase, the model is then presented with a combination of S1 and S2 in the input layer, and is then given the following choices (choices available to the network are determined again by simply biasing the activity of the candidate motor cortical units):
i) R1 vs. either R3 or R4. This is equivalent to choosing a response that had been rewarded on 80% of trials over those that had been rewarded less often (60 or 40 %, so on average these alternative responses have 50% neutral value, as in the actual task).
ii) R2 vs either R3 or R4. This is equivalent to choosing between a response that had been rewarded on only 20% of trials (and punished on 80% of trials) and the other more neutral ones.
Thus case i) is equivalent to \"choose-A\" in the probabilistic selection task, wheras case ii) is equivalent to \"avoid-B\". No feedback is given during this phase, so choices reflect only performance based on past learning.
To run a batch of intact networks, on the MasterControl panel make sure num_intact_snc_units is set to 4. Then just click Init and Run, which will run a batch of 50 networks for 30 epochs of training and 30 epochs of testing (repeated presentations of test trials without learning to get sufficient statistics on choice accuracy for each network). When it's done, check out the Stats table under AnalysisData, which presents summary statistics of choices made across all networks as a function of trial type. The first two rows are average choices in the training phase of the task (averaged across all epochs so this measure is an under-estimation of the asymptotic performance in the trials). The second two rows are the critical choose-A and avoid-B measures averaged across all test trials after learning (these are also plotted in the graph on the right panel).
In the A trials, the networks should choose R1 over R3 or R4. You should see that r1_mean is indeed high (substantially above 0.5), indicating that networks do tend to choose A on most of these trials. r2_mean should be 0 (or very close to it) because the \"B\" response was never eligible on A trials, whereas R3 and R4 likely have non-zero means (due to imperfect choice of R1). (Note that the means for R3 and R4 are calculated across all A trials even though only one of R3 or R4 were eligible - thus the actual proportion of trials in which R3 and R4 were chosen over R1 when they were eligible is twice that shown in the table -- still substantially less than R1).
In the B trials, the network should avoid R2 over R3 and R4. You should see that r2_mean is indeed less than 0.5 indicated that networks avoid it (closer to 0 means better avoidance and more selection of the alternative choices; thus 'avoid-B' accuracy is (1-r2_mean)). Again choices of r3 and r4 when they were eligible is twice that shown, so you should see that r2 was avoided more than either of these. In both A and B trials however, choices of the suboptimal trials nevertheless occur in proportion to their relative values - r3 should be selected more consistently than r4. This is the basic prediction of the softmax logistic function often used to summarize BG choice -- that choices are made probabilistically as a function of the relative difference in values between alternative responses. To test the effect of Parkinson's disease, set the num_intact_snc_units to 2 instead of 4 (i.e. 50% DA damage - you can also go all the way down to 1 but this can lead to very degraded overall performance). Re-run a batch of networks and you should see that choose-A performance is substantially worse than in the intact case, whereas avoid-B performance is preserved or even enhanced.
You can also run an intermediate case of num_intact_snc_units =3. You should see that relative performance in choose-A vs avoid-B is greater than with more damage (snc=2 or 1) and less than that with higher dopamine levels (snc =4). Thus these simulations capture the basic dissociation seen in the empirical studies in terms of choice performance on these test trials as a function of dopamine depletion and stimulation.
== learning vs expression and levodopa vs D2 agonists ==
You can simulate the effects of D2 agonists given to Parkinson's patients by simply increasing the strength of the D2 projections onto NoGo units, so that effectively there is more D2 stimulation. You can simulate these effects during acquisiton/learning, during test phase, or both. First increase the num_intact_snc_units back to 4, given that levodopa medication replenishes dopamine levels. To increase D2 stimulation, change the d2_acq and d2_perf (acquisition and peformance) from the default of 0.075 to twice that amount, 0.15.
You should see that when increasing D2 stimulation during acquisition, which prevents NoGo units from responding to DA dips, avoid-B performance is impaired, as seen in PD patients on medication.
Also,if you increase D2 stimulation only during the test phase , without affecting it during learning (ie. d2_acq = 0.075 and d2_perf =0.15), that this now increases choose-A performance and decreases avoid-B. This shows that D2 stimulation can increase the *expression* of relative reward-based action selection, as has been shown e.g. in Shiner et al 2012.
== A few details ==
Note that tonic dopamine levels are relatively low in this network to ensure that nogo units are sufficiently able to become active and prevent action selection for negative S-R combinations. This also means that early during learning, particularly for the Parkinson's networks, you may not see any response being gated, but choices are determined primarily by noise at the level of motor cortex (a simple mechanism forexploration). Nevertheless, as learning occurs, some responses are reinforced more than others and BG gating becomes common, leading to reliable choice of the more rewarding stimulus-response combinations (and avoidance of the negative ones). Note also that all accuracy analysis occur after filtering out trials in which a response was not gated by the maximum 150 cycles of each trial (otherwise choices selected in these trials are random, due only to motor cortical noise). The dynamics of this network and tonic dopamine levels are such that a Go representation becomes transiently active long enough to gate a response but is then usually inhibited by corresponding NoGo activity (there are direct NoGo->Go inhibitory projections, consistent with evidence from the Surmeier lab). Subsequent DA bursts will excite and drive Go learning as usual. Otherwise, there is NoGo learning (due to NoGo activity and Hebbian learning), which does not depend on the DA dip (drop from tonic levels). For this reason we do not model the agonist medication effect as a reduced DA dip, as we have in the other simulations, but rather as simply increased D2 receptor stimulation (as noted above). However the same mechanisms still apply and the network could be parametrized so that the dip is still functionally effective as in the other cases.
Finally, you may notice that there is a Context layer as an additional Input. This is meant for other tasks in which the stimulus representation in the Input layer sometimes is contextualized by other contexts (e.g. a shape in the input is contextualized by its color). In the current task the context is always constant (the same representation), so this layer doesn't play a role (nevertheless the network is parameterized so that it expects a certain level of input from this layer).
";
};
};
wizards {
name="wizards";
el_typ=LeabraWizard;
el_def=0;
LeabraWizard @["LeabraWizard_2"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItemBase;
el_def=0;
UserDataItem @["NO_CLIP"] {
name="NO_CLIP";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="LeabraWizard_2";
};
};
ctrl_panels {
name="ctrl_panels";
el_typ=ControlPanel;
el_def=0;
ControlPanel @["MasterControl"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["user_pinned"] {
name="user_pinned";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="MasterControl";
updt_while_running=0;
desc=;
mbrs {
name="mbrs";
el_typ=EditMbrItem;
el_def=0;
EditMbrItem @[0] {
label="tonic_DA";
desc=" real value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["tonic_DA"]$$;
mbr=ProgVar::real_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[1] {
label="DA_burst_";
desc=" real value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["DA_burst_val"]$$;
mbr=ProgVar::real_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[2] {
label="DA_dip_";
desc=" real value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["DA_dip_val"]$$;
mbr=ProgVar::real_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[3] {
label="num_intact_snc_units";
desc=" integer value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["num_intact_snc_units"]$$;
mbr=ProgVar::int_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[4] {
label="burst_pause_duration_";
desc=" the expression to compute and assign to the member
: enter the expression here -- use Ctrl-L to pull up a lookup dialog for members, methods, types, etc -- or you can just type in names of program variables or literal values. enclose strings in double quotes. variable names will be checked and automatically updated
var lookup: lookup a program variable and add it to the current expression (this field then returns to empty/NULL)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].prog_code[6].true_code[0]$$;
mbr=MemberAssign::expr;
is_numeric=0;
is_single=0;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[5] {
label="d2_acq";
desc=" real value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].prog_code[0].local_vars["d2_acq"]$$;
mbr=ProgVar::real_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
EditMbrItem @[6] {
label="d2_perf";
desc=" real value -- this is the current actual value of the variable at all times for global variables, and is used as an initialization value for local variables (they start with this value, but what you see here is NOT their current value as the program runs)";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].prog_code[0].local_vars["d2_perf"]$$;
mbr=ProgVar::real_val;
is_numeric=1;
is_single=1;
param_search {
record=0;
search=0;
range="0:1:0.1";
};
param_set_value {
saved_value=;
};
notes {
notes=;
};
};
};
mths {
name="mths";
el_typ=EditMthItem;
el_def=0;
group_type=GT_BUTTONS;
EditMthItem @[0] {
label="Init";
desc=" run init_code, global variables retain current values unless reset in the init_code";
cust_desc=0;
base=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"]$$;
mth=Program::Init;
};
EditMthItem @[1] {
label="Run";
desc=" run the program -- if not yet Init, will run Init first";
cust_desc=0;
base=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"]$;
mth=Program::Run_Gui;
};
EditMthItem @[2] {
label="Step";
desc=" step the program at the level of the given program -- if NULL then step_prog default value will be used";
cust_desc=0;
base=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"]$;
mth=Program::Step_Gui;
};
EditMthItem @[3] {
label="Stop";
desc=" stop the current program at its next natural stopping point (i.e., cleanly stopping when appropriate chunks of computation have completed)";
cust_desc=0;
base=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"]$;
mth=Program::Stop;
};
};
};
ClusterRun @["ClusterRun"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["user_pinned"] {
name="user_pinned";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ClusterRun";
updt_while_running=0;
desc=;
mbrs {
name="mbrs";
el_typ=EditMbrItem;
el_def=0;
};
mths {
name="mths";
el_typ=EditMthItem;
el_def=0;
group_type=GT_BUTTONS;
};
jobs_running {
name="jobs_running";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["cluster"] {
name="cluster";
desc="name of cluster to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user who ran this job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["tag"] {
name="tag";
desc="unique tag id for this job -- all files etc are named according to this tag";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status"] {
name="status";
desc="status of job: REQUESTED, CANCELLED, SUBMITTED, QUEUED, RUNNING, DONE, KILLED";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["label"] {
name="label";
desc="label for the job -- a brief description that you can use to label this job's results on your graph -- in general notes should have more general info and then label should JUST describe what is unique about the current run";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["notes"] {
name="notes";
desc="notes for the job -- describe any specific information about the model configuration etc -- can use this for searching and sorting results";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["filename"] {
name="filename";
desc="name of the specific project used for this job -- because multiple versions of a model are often run under the same project name";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["params"] {
name="params";
desc="emergent parameters based on currently selected items in the ClusterRun";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status_info"] {
name="status_info";
desc="more detailed information about status";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_time"] {
name="submit_time";
desc="when was the job submitted (tracks time from emergent client submission)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["start_time"] {
name="start_time";
desc="when did the job actually start running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["end_time"] {
name="end_time";
desc="when did the job finish running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["running_time"] {
name="running_time";
desc="total running time in days/hours/minutes";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_no"] {
name="job_no";
desc="job number on cluster -- assigned once the job is submitted to the cluster";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out"] {
name="job_out";
desc="job output information -- contains (top of) the job standard output and standard error output as the job is running (truncated to top 2048 characters if longer than that) -- full information available in job_out_file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out_file"] {
name="job_out_file";
desc="job output file -- file name containing full job output information -- file name should be tag.out";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["dat_files"] {
name="dat_files";
desc="list of data table output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name, and end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["other_files"] {
name="other_files";
desc="list of other output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name but do not end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["command_id"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="command_id";
desc="id for this command, assigned by the search algorithm in an algorithm-specific manner (optional)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["command"] {
name="command";
desc="emergent command line, up to point of parameters";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["repo_url"] {
name="repo_url";
desc="name of repository to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["queue"] {
name="queue";
desc="if specified, indicate a particular queue on the computing resource";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["run_time"] {
name="run_time";
desc="how long will the jobs take to run -- syntax is number followed by unit indicator -- m=minutes, h=hours, d=days -- e.g., 30m, 12h, or 2d -- typically the job will be killed if it exceeds this amount of time, so be sure to not underestimate";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["ram_gb"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ram_gb";
desc="how many gigabytes of ram is required? 0 means do not specify this parameter for the job submission -- for large memory jobs, it can be important to specify this to ensure proper allocation of resources";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["n_threads"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="n_threads";
desc="number of parallel threads to use for running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_nodes";
desc="number of physical nodes to use for mpi run -- 0 or -1 means not to use mpi";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_per_node"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_per_node";
desc="number of processes to use per MPI node to use for mpi run - total nodes is mpi_nodes * mpi_per_node";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_batches"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_batches";
desc="if > 0, use parallel batch mode with this number of batches";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_nodes";
desc="actually pb_n_batches_per -- re-using this parameter that was previously used for a different purpose -- number of batches to run sequentially within a single job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_svn"] {
name="submit_svn";
desc="svn revision for the original job submission";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_job"] {
name="submit_job";
desc="index of job number within a given submission -- equal to the row number of the original set of jobs submitted in submit_svn jobs";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["done_svn"] {
name="done_svn";
desc="svn revision when this job was moved from running to done -- this will contain full set of files generated when running -- for deleted jobs can also recover to this";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["last_svn"] {
name="last_svn";
desc="last svn revision for command submission that affected this job in some significant way -- for deleted jobs, this is the svn revision that we recover to";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
jobs_done {
name="jobs_done";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["cluster"] {
name="cluster";
desc="name of cluster to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user who ran this job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["tag"] {
name="tag";
desc="unique tag id for this job -- all files etc are named according to this tag";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status"] {
name="status";
desc="status of job: REQUESTED, CANCELLED, SUBMITTED, QUEUED, RUNNING, DONE, KILLED";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["label"] {
name="label";
desc="label for the job -- a brief description that you can use to label this job's results on your graph -- in general notes should have more general info and then label should JUST describe what is unique about the current run";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["notes"] {
name="notes";
desc="notes for the job -- describe any specific information about the model configuration etc -- can use this for searching and sorting results";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["filename"] {
name="filename";
desc="name of the specific project used for this job -- because multiple versions of a model are often run under the same project name";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["params"] {
name="params";
desc="emergent parameters based on currently selected items in the ClusterRun";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status_info"] {
name="status_info";
desc="more detailed information about status";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_time"] {
name="submit_time";
desc="when was the job submitted (tracks time from emergent client submission)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["start_time"] {
name="start_time";
desc="when did the job actually start running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["end_time"] {
name="end_time";
desc="when did the job finish running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["running_time"] {
name="running_time";
desc="total running time in days/hours/minutes";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_no"] {
name="job_no";
desc="job number on cluster -- assigned once the job is submitted to the cluster";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out"] {
name="job_out";
desc="job output information -- contains (top of) the job standard output and standard error output as the job is running (truncated to top 2048 characters if longer than that) -- full information available in job_out_file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out_file"] {
name="job_out_file";
desc="job output file -- file name containing full job output information -- file name should be tag.out";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["dat_files"] {
name="dat_files";
desc="list of data table output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name, and end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["other_files"] {
name="other_files";
desc="list of other output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name but do not end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["command_id"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="command_id";
desc="id for this command, assigned by the search algorithm in an algorithm-specific manner (optional)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["command"] {
name="command";
desc="emergent command line, up to point of parameters";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["repo_url"] {
name="repo_url";
desc="name of repository to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["queue"] {
name="queue";
desc="if specified, indicate a particular queue on the computing resource";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["run_time"] {
name="run_time";
desc="how long will the jobs take to run -- syntax is number followed by unit indicator -- m=minutes, h=hours, d=days -- e.g., 30m, 12h, or 2d -- typically the job will be killed if it exceeds this amount of time, so be sure to not underestimate";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["ram_gb"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ram_gb";
desc="how many gigabytes of ram is required? 0 means do not specify this parameter for the job submission -- for large memory jobs, it can be important to specify this to ensure proper allocation of resources";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["n_threads"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="n_threads";
desc="number of parallel threads to use for running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_nodes";
desc="number of physical nodes to use for mpi run -- 0 or -1 means not to use mpi";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_per_node"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_per_node";
desc="number of processes to use per MPI node to use for mpi run - total nodes is mpi_nodes * mpi_per_node";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_batches"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_batches";
desc="if > 0, use parallel batch mode with this number of batches";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_nodes";
desc="actually pb_n_batches_per -- re-using this parameter that was previously used for a different purpose -- number of batches to run sequentially within a single job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_svn"] {
name="submit_svn";
desc="svn revision for the original job submission";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_job"] {
name="submit_job";
desc="index of job number within a given submission -- equal to the row number of the original set of jobs submitted in submit_svn jobs";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["done_svn"] {
name="done_svn";
desc="svn revision when this job was moved from running to done -- this will contain full set of files generated when running -- for deleted jobs can also recover to this";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["last_svn"] {
name="last_svn";
desc="last svn revision for command submission that affected this job in some significant way -- for deleted jobs, this is the svn revision that we recover to";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
jobs_deleted {
name="jobs_deleted";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["cluster"] {
name="cluster";
desc="name of cluster to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user who ran this job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["tag"] {
name="tag";
desc="unique tag id for this job -- all files etc are named according to this tag";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status"] {
name="status";
desc="status of job: REQUESTED, CANCELLED, SUBMITTED, QUEUED, RUNNING, DONE, KILLED";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["label"] {
name="label";
desc="label for the job -- a brief description that you can use to label this job's results on your graph -- in general notes should have more general info and then label should JUST describe what is unique about the current run";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["notes"] {
name="notes";
desc="notes for the job -- describe any specific information about the model configuration etc -- can use this for searching and sorting results";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["filename"] {
name="filename";
desc="name of the specific project used for this job -- because multiple versions of a model are often run under the same project name";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["params"] {
name="params";
desc="emergent parameters based on currently selected items in the ClusterRun";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status_info"] {
name="status_info";
desc="more detailed information about status";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_time"] {
name="submit_time";
desc="when was the job submitted (tracks time from emergent client submission)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["start_time"] {
name="start_time";
desc="when did the job actually start running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["end_time"] {
name="end_time";
desc="when did the job finish running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["running_time"] {
name="running_time";
desc="total running time in days/hours/minutes";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_no"] {
name="job_no";
desc="job number on cluster -- assigned once the job is submitted to the cluster";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out"] {
name="job_out";
desc="job output information -- contains (top of) the job standard output and standard error output as the job is running (truncated to top 2048 characters if longer than that) -- full information available in job_out_file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out_file"] {
name="job_out_file";
desc="job output file -- file name containing full job output information -- file name should be tag.out";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["dat_files"] {
name="dat_files";
desc="list of data table output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name, and end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["other_files"] {
name="other_files";
desc="list of other output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name but do not end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["command_id"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="command_id";
desc="id for this command, assigned by the search algorithm in an algorithm-specific manner (optional)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["command"] {
name="command";
desc="emergent command line, up to point of parameters";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["repo_url"] {
name="repo_url";
desc="name of repository to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["queue"] {
name="queue";
desc="if specified, indicate a particular queue on the computing resource";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["run_time"] {
name="run_time";
desc="how long will the jobs take to run -- syntax is number followed by unit indicator -- m=minutes, h=hours, d=days -- e.g., 30m, 12h, or 2d -- typically the job will be killed if it exceeds this amount of time, so be sure to not underestimate";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["ram_gb"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ram_gb";
desc="how many gigabytes of ram is required? 0 means do not specify this parameter for the job submission -- for large memory jobs, it can be important to specify this to ensure proper allocation of resources";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["n_threads"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="n_threads";
desc="number of parallel threads to use for running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_nodes";
desc="number of physical nodes to use for mpi run -- 0 or -1 means not to use mpi";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_per_node"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_per_node";
desc="number of processes to use per MPI node to use for mpi run - total nodes is mpi_nodes * mpi_per_node";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_batches"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_batches";
desc="if > 0, use parallel batch mode with this number of batches";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_nodes";
desc="actually pb_n_batches_per -- re-using this parameter that was previously used for a different purpose -- number of batches to run sequentially within a single job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_svn"] {
name="submit_svn";
desc="svn revision for the original job submission";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_job"] {
name="submit_job";
desc="index of job number within a given submission -- equal to the row number of the original set of jobs submitted in submit_svn jobs";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["done_svn"] {
name="done_svn";
desc="svn revision when this job was moved from running to done -- this will contain full set of files generated when running -- for deleted jobs can also recover to this";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["last_svn"] {
name="last_svn";
desc="last svn revision for command submission that affected this job in some significant way -- for deleted jobs, this is the svn revision that we recover to";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name=;
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name=;
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
jobs_archive {
name="jobs_archive";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["cluster"] {
name="cluster";
desc="name of cluster to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user who ran this job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["tag"] {
name="tag";
desc="unique tag id for this job -- all files etc are named according to this tag";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status"] {
name="status";
desc="status of job: REQUESTED, CANCELLED, SUBMITTED, QUEUED, RUNNING, DONE, KILLED";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["label"] {
name="label";
desc="label for the job -- a brief description that you can use to label this job's results on your graph -- in general notes should have more general info and then label should JUST describe what is unique about the current run";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["notes"] {
name="notes";
desc="notes for the job -- describe any specific information about the model configuration etc -- can use this for searching and sorting results";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["filename"] {
name="filename";
desc="name of the specific project used for this job -- because multiple versions of a model are often run under the same project name";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["params"] {
name="params";
desc="emergent parameters based on currently selected items in the ClusterRun";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["status_info"] {
name="status_info";
desc="more detailed information about status";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_time"] {
name="submit_time";
desc="when was the job submitted (tracks time from emergent client submission)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["start_time"] {
name="start_time";
desc="when did the job actually start running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["end_time"] {
name="end_time";
desc="when did the job finish running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["running_time"] {
name="running_time";
desc="total running time in days/hours/minutes";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_no"] {
name="job_no";
desc="job number on cluster -- assigned once the job is submitted to the cluster";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out"] {
name="job_out";
desc="job output information -- contains (top of) the job standard output and standard error output as the job is running (truncated to top 2048 characters if longer than that) -- full information available in job_out_file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_out_file"] {
name="job_out_file";
desc="job output file -- file name containing full job output information -- file name should be tag.out";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["dat_files"] {
name="dat_files";
desc="list of data table output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name, and end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["other_files"] {
name="other_files";
desc="list of other output (results) files generated by model (space separated) -- these files have the tag in their name but do not end in .dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["command_id"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="command_id";
desc="id for this command, assigned by the search algorithm in an algorithm-specific manner (optional)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["command"] {
name="command";
desc="emergent command line, up to point of parameters";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["repo_url"] {
name="repo_url";
desc="name of repository to run job on";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["queue"] {
name="queue";
desc="if specified, indicate a particular queue on the computing resource";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["run_time"] {
name="run_time";
desc="how long will the jobs take to run -- syntax is number followed by unit indicator -- m=minutes, h=hours, d=days -- e.g., 30m, 12h, or 2d -- typically the job will be killed if it exceeds this amount of time, so be sure to not underestimate";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["ram_gb"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ram_gb";
desc="how many gigabytes of ram is required? 0 means do not specify this parameter for the job submission -- for large memory jobs, it can be important to specify this to ensure proper allocation of resources";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["n_threads"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="n_threads";
desc="number of parallel threads to use for running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_nodes";
desc="number of physical nodes to use for mpi run -- 0 or -1 means not to use mpi";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["mpi_per_node"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="mpi_per_node";
desc="number of processes to use per MPI node to use for mpi run - total nodes is mpi_nodes * mpi_per_node";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_batches"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_batches";
desc="if > 0, use parallel batch mode with this number of batches";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["pb_nodes"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="pb_nodes";
desc="actually pb_n_batches_per -- re-using this parameter that was previously used for a different purpose -- number of batches to run sequentially within a single job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_svn"] {
name="submit_svn";
desc="svn revision for the original job submission";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["submit_job"] {
name="submit_job";
desc="index of job number within a given submission -- equal to the row number of the original set of jobs submitted in submit_svn jobs";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["done_svn"] {
name="done_svn";
desc="svn revision when this job was moved from running to done -- this will contain full set of files generated when running -- for deleted jobs can also recover to this";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["last_svn"] {
name="last_svn";
desc="last svn revision for command submission that affected this job in some significant way -- for deleted jobs, this is the svn revision that we recover to";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
file_list {
name="file_list";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["cluster"] {
name="cluster";
desc="cluster where this job was submitted / run";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user who ran this job";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["file_name"] {
name="file_name";
desc="name of file -- does not include any path information";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["tag"] {
name="tag";
desc="job tag associated with this file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["size"] {
name="size";
desc="size of file -- with typical suffixes (K = kilobytes, M = megabytes, G = gigabytes)";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["kind"] {
name="kind";
desc="type of file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["date_modified"] {
name="date_modified";
desc="timestamp for when the file was last modified";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["date_created"] {
name="date_created";
desc="timestamp for when the file was first created";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["svn_file_path"] {
name="svn_file_path";
desc="path to file in SVN repository, relative to root of svn_repo repository";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["proj_file_path"] {
name="proj_file_path";
desc="path to file relative to the parent project directory -- e.g., results/filename.dat";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["file_path"] {
name="file_path";
desc="full path to file on local file system, including all parent directories and name of file -- takes you directly to the file";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
cluster_info {
name="cluster_info";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["queue"] {
name="queue";
desc="queue that this info relates to";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["job_no"] {
name="job_no";
desc="job number or total number of actve jobs";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["user"] {
name="user";
desc="user name";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["state"] {
name="state";
desc="current scheduler state -- or description of global state info";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["procs"] {
name="procs";
desc="number of processors for this job or for global state info";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["start_time"] {
name="start_time";
desc="timestamp for when the job was submitted or started running";
col_flags=SAVE_DATA|READ_ONLY;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
search_algos {
name="search_algos";
el_typ=ParamSearchAlgo;
el_def=0;
};
use_search_algo=0;
cur_search_algo=NULL;
set_proj_name=0;
proj_name=;
auto_updt_interval=10;
auto_updt_timeout=30;
cluster=;
clusters=;
users=;
last_submit_time=;
notes=;
label=;
extra_files=;
svn_repo=;
repo_url=;
queue=;
run_time=;
exe_cmd="emergent7";
ram_gb=0;
n_threads=1;
use_mpi=0;
mpi_nodes=10;
mpi_per_node=1;
parallel_batch=0;
pb_batches=10;
pb_n_batches_per=1;
nowin_x=0;
enable_kill=0;
enable_load=0;
enable_notes=0;
};
};
param_sets {
name="param_sets";
el_typ=ParamSet;
el_def=0;
};
data {
name="data";
el_typ=DataTable;
el_def=0;
save_tables=1;
DataTable_Group @.gp["InputData"] {
name="InputData";
el_typ=DataTable;
el_def=0;
save_tables=1;
DataTable @["StdInputData"] {
name="StdInputData";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["Name"] {
name="Name";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
ar {
name="ar";
[2] "8020_R1R2";"6040_R3R4"; };
};
float_Data @["Motor_Cortex"] {
name="Motor_Cortex";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 4;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[4 2 2] 1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;
0;0;0;1;0;0; };
};
float_Data @["Output"] {
name="Output";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 4;1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[4 1 2] 1;0;0;0;0;1;0;0; };
};
float_Data @["Input"] {
name="Input";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 6;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[6 2 2] 0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;
0;0;0;0; };
};
float_Data @["Context"] {
name="Context";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 9;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[9 2 2] 1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;
1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;
1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;
0;0;0;0;0;0; };
};
float_Data @["SNc2"] {
name="SNc2";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 2;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[2 2 2] 0;0;0;0;0;0;0;0; };
};
float_Data @["SNc"] {
name="SNc";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 2;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[2 2 2] 0;0;0;0;0;0;0;0; };
};
int_Data @["Name_No"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Name_No";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
ar {
name="ar";
[2] 0;1; };
};
};
data_flags=SAVE_ROWS|AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
row_indexes {
name="row_indexes";
[2] 0;1; };
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
DataTable @["TransferInputData"] {
name="TransferInputData";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["Name"] {
name="Name";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
ar {
name="ar";
[2] "comboA";"comboB"; };
};
float_Data @["Motor_Cortex"] {
name="Motor_Cortex";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 4;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[4 2 2] 0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;
0;0;0;1;0;0; };
};
float_Data @["Output"] {
name="Output";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 4;1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[4 1 2] 0;1;0;0;0;1;0;0; };
};
float_Data @["Input"] {
name="Input";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 6;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[6 2 2] 1;1;1;0;0;0;1;1;1;0;
0;0;1;1;1;0;0;0;1;1;
1;0;0;0; };
};
float_Data @["Context"] {
name="Context";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 9;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[9 2 2] 1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;
1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;
1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;
0;0;0;0;0;0; };
};
float_Data @["SNc2"] {
name="SNc2";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 2;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[2 2 2] 0;0;0;0;0;0;0;0; };
};
float_Data @["SNc"] {
name="SNc";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 2;2; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
ar {
name="ar";
[2 2 2] 0;0;0;0;0;0;0;0; };
};
int_Data @["Name_No"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Name_No";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
ar {
name="ar";
[2] 1;1; };
};
};
data_flags=SAVE_ROWS|AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
row_indexes {
name="row_indexes";
[2] 0;1; };
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
};
DataTable_Group @.gp["OutputData"] {
name="OutputData";
el_typ=DataTable;
el_def=0;
save_tables=1;
DataTable @["TrialOutputData"] {
name="TrialOutputData";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=int_Data;
el_def=0;
int_Data @["batch"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_73";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="batch";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[6000] 0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
2;2;2;2;2;2;2;2;2;2;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
3;3;3;3;3;3;3;3;3;3;
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5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
5;5;5;5;5;5;5;5;5;5;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
6;6;6;6;6;6;6;6;6;6;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
7;7;7;7;7;7;7;7;7;7;
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8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
8;8;8;8;8;8;8;8;8;8;
9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
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9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
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9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
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9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;
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12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
12;12;12;12;12;12;12;12;12;12;
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84;139;87;84;86;66;61;150;64;150;
150;97;139;150;150;67;150;82;150;82;
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150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
150;150;150;150;150;150;87;150;150;79;
150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
119;150;150;64;90;150;72;150;150;79;
65;150;150;106;87;150;150;75;66;150;
73;150;64;150;59;150;150;76;150;86;
150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
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150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
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62;150;150;62;79;150;81;150;69;150;
150;64;70;150;72;136;64;150;150;66;
150;61;150;62;61;150;150;66;150;62;
63;150;66;150;60;150;150;63;150;64;
150;150;150;150;67;150;150;60;87;150;
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150;150;150;150;150;150;150;150;114;74;
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150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
150;150;150;150;150;150;150;150;150;150;
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2320;2321;2322;2323;2324;2325;2326;2327;2328;2329;
2330;2331;2332;2333;2334;2335;2336;2337;2338;2339;
2340;2341;2342;2343;2344;2345;2346;2347;2348;2349;
2350;2351;2352;2353;2354;2355;2356;2357;2358;2359;
2360;2361;2362;2363;2364;2365;2366;2367;2368;2369;
2370;2371;2372;2373;2374;2375;2376;2377;2378;2379;
2380;2381;2382;2383;2384;2385;2386;2387;2388;2389;
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2410;2411;2412;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;
2420;2421;2422;2423;2424;2425;2426;2427;2428;2429;
2430;2431;2432;2433;2434;2435;2436;2437;2438;2439;
2440;2441;2442;2443;2444;2445;2446;2447;2448;2449;
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2500;2501;2502;2503;2504;2505;2506;2507;2508;2509;
2510;2511;2512;2513;2514;2515;2516;2517;2518;2519;
2520;2521;2522;2523;2524;2525;2526;2527;2528;2529;
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2620;2621;2622;2623;2624;2625;2626;2627;2628;2629;
2630;2631;2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;
2640;2641;2642;2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649;
2650;2651;2652;2653;2654;2655;2656;2657;2658;2659;
2660;2661;2662;2663;2664;2665;2666;2667;2668;2669;
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2680;2681;2682;2683;2684;2685;2686;2687;2688;2689;
2690;2691;2692;2693;2694;2695;2696;2697;2698;2699;
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2720;2721;2722;2723;2724;2725;2726;2727;2728;2729;
2730;2731;2732;2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;
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2760;2761;2762;2763;2764;2765;2766;2767;2768;2769;
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2780;2781;2782;2783;2784;2785;2786;2787;2788;2789;
2790;2791;2792;2793;2794;2795;2796;2797;2798;2799;
2800;2801;2802;2803;2804;2805;2806;2807;2808;2809;
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2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;
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2940;2941;2942;2943;2944;2945;2946;2947;2948;2949;
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2970;2971;2972;2973;2974;2975;2976;2977;2978;2979;
2980;2981;2982;2983;2984;2985;2986;2987;2988;2989;
2990;2991;2992;2993;2994;2995;2996;2997;2998;2999;
};
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
DataTable @["CycleOutputData"] {
name="CycleOutputData";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=int_Data;
el_def=0;
int_Data @["batch"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_43";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
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name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="batch";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["epoch"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_44";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="epoch";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["trial"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_45";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="trial";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["trial_name"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_87";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="trial_name";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
String_Data @["group_name"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_88";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="group_name";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["phase_no"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_46";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="phase_no";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
int_Data @["cycle"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_47";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="cycle";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["sse"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_89";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="sse";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["ext_rew"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_90";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="ext_rew";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["STN_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_91";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="STN_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["PMC_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_92";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="PMC_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["Thalam_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_93";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Thalam_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["GP_Int_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_94";
el_typ=UserDataItem;
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name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="GP_Int_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["GP_Ext_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_95";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="GP_Ext_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["Output_act"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_96";
el_typ=UserDataItem;
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name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Output_act";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=1;
cell_geom{ 4;1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[2] ;; };
width=0;
};
float_Data @["Output_units_0_act"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_97";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Output_units_0_act";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
float_Data @["SNc_acts_avg"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_98";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.2057613134384155;
val_type_fixed=0;
};
};
name="SNc_acts_avg";
col_flags=SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=0;
};
};
data_flags=AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
};
DataTable_Group @.gp["AnalysisData"] {
name="AnalysisData";
el_typ=DataTable;
el_def=0;
save_tables=1;
DataTable @["TrialOutputData_Group"] {
name="TrialOutputData_Group";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["trial_name_group"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_81";
el_typ=UserDataItem;
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name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="trial_name_group";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
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"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";"6040_R3R4";
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100;101;102;103;104;105;106;107;108;109;
110;111;112;113;114;115;116;117;118;119;
120;121;122;123;124;125;126;127;128;129;
130;131;132;133;134;135;136;137;138;139;
140;141;142;143;144;145;146;147;148;149;
150;151;152;153;154;155;156;157;158;159;
160;161;162;163;164;165;166;167;168;169;
170;171;172;173;174;175;176;177;178;179;
180;181;182;183;184;185;186;187;188;189;
};
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
DataTable @["Stats"] {
name="Stats";
desc=;
data {
name="data";
el_typ=String_Data;
el_def=0;
String_Data @["trial_name_group_group"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_81";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="trial_name_group_group";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] "6040_R3R4";"8020_R1R2";"comboA";"comboB"; };
};
float_Data @["r1_mean_mean"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_75";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r1_mean_mean";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.020408163;0.73132873;0.70534915;0.0019762847; };
};
float_Data @["r1_mean_sem"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_75";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r1_mean_sem";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.020408163;0.050967176;0.045831129;0.0019762858; };
};
float_Data @["r2_mean_mean"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_76";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r2_mean_mean";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.0028722603;0.21643738;0.013571931;0.38728923; };
};
float_Data @["r2_mean_sem"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_76";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r2_mean_sem";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.0020126258;0.045326982;0.0095938602;0.045421336; };
};
float_Data @["r3_mean_mean"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_77";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r3_mean_mean";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.51375312;0.029045571;0.19876195;0.31240192; };
};
float_Data @["r3_mean_sem"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_77";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r3_mean_sem";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.062492326;0.012881882;0.041374605;0.04265625; };
};
float_Data @["r4_mean_mean"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_78";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r4_mean_mean";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.46296641;0.023188407;0.082316972;0.29833257; };
};
float_Data @["r4_mean_sem"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_78";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["NARROW"] {
name="NARROW";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_panel_wd"] {
name="view_panel_wd";
value 6 0=0.1092715263366699;
val_type_fixed=0;
};
};
name="r4_mean_sem";
col_flags=MARK|PIN|SAVE_DATA;
is_matrix=0;
cell_geom{ 1; };
calc_expr {
expr=;
};
dim_names {
name="dim_names";
[0] };
width=66;
ar {
name="ar";
[4] 0.061922319;0.016734784;0.01796082;0.046022452; };
};
};
data_flags=SAVE_ROWS|AUTO_CALC;
auto_load=NO_AUTO_LOAD;
auto_load_file=;
row_height=0;
keygen 4 0=0;
row_indexes {
name="row_indexes";
[4] 0;1;2;3; };
last_sort_spec {
name="last_sort_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSortEl;
el_def=0;
};
};
control_panel_cells {
name="control_panel_cells";
el_typ=DataTableCell;
el_def=0;
};
};
};
};
programs {
name="programs";
el_typ=Program;
el_def=0;
tags=;
desc=;
debug_mode=0;
Program_Group @.gp["LeabraAll_Std"] {
name="LeabraAll_Std";
el_typ=Program;
el_def=0;
tags="Leabra, Std, All";
desc="The full set of programs for training a standard Leabra network";
debug_mode=0;
Program @["LeabraBatch"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].doc$$;
};
};
name="LeabraBatch";
short_nm="Batch";
tags="Leabra, Std";
desc="Iterate over training runs (a batch of training runs) -- just a simple loop that calls training program";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["StdInputData"]$$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="datatable with training patterns -- not used by this program, but passed to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["NLoops"] {
name="NLoops";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="batch counter";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["batch"] {
name="batch";
var_type=T_Int;
int_val=50;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="batch counter";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["meds"] {
name="meds";
var_type=T_Bool;
bool_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="simulate da meds (reduced da dip)?";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["DA_dip_val"] {
name="DA_dip_val";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["trl_out_data"] {
name="trl_out_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["TrialOutputData"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="datatable with training patterns";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["trl_group"] {
name="trl_group";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["AnalysisData"]["TrialOutputData_Group"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="datatable with training patterns";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["stats"] {
name="stats";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["AnalysisData"]["Stats"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="datatable with training patterns";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["max_batch"] {
name="max_batch";
var_type=T_Int;
int_val=50;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="maximum number of batch runs to perform";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["num_intact_snc_units"] {
name="num_intact_snc_units";
var_type=T_Int;
int_val=4;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initializes local batch counter and batch field on network";
flags=0;
code_string="Net Counter Init: batch";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: batch";
network_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["network"]$$;
local_ctr_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["batch"]$$;
counter=Network::batch;
update_after=0;
};
If @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (meds==true)";
pre_compile_code_string="if (meds==true)";
cond {
expr="meds==true";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="DA_dip_val = .025";
pre_compile_code_string="DA_dip_val = .025";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["DA_dip_val"]$$;
expr {
expr=".025";
};
};
OtherProgramVar @[1] {
desc=;
flags=0;
code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=DA_dip_val var_2=? var_3=? var_4=? ";
pre_compile_code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=DA_dip_val var_2=? var_3=? var_4=? ";
other_prog=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"]$$;
set_other=1;
var_1=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["DA_dip_val"]$;
var_2=NULL;
var_3=NULL;
var_4=NULL;
};
};
};
Else @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="DA_dip_val = 0";
pre_compile_code_string="DA_dip_val = 0";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["DA_dip_val"]$;
expr {
expr="0";
};
};
OtherProgramVar @[1] {
desc=;
flags=0;
code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=DA_dip_val var_2=? var_3=? var_4=? ";
pre_compile_code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=DA_dip_val var_2=? var_3=? var_4=? ";
other_prog=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"]$;
set_other=1;
var_1=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["DA_dip_val"]$;
var_2=NULL;
var_3=NULL;
var_4=NULL;
};
};
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initializes local batch counter and batch field on network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Init: batch";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: batch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["batch"]$;
counter=Network::batch;
update_after=0;
};
WhileLoop @[1] {
desc="the main loop over training runs";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="while (batch < max_batch)";
pre_compile_code_string="while (batch < max_batch)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ProgramCall @[0] {
desc="run the training program -- sets the network and input_data args";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraTrain(network, input_data, FlatNetwork, true)";
pre_compile_code_string="LeabraTrain(network, input_data, FlatNetwork, true)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
ProgArg @[3] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="no_prompts";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"]$$;
targ_ld_init="*LeabraTrain*";
};
NetCounterIncr @[1] {
desc="increment the local batch counter and copy to network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Incr: batch";
pre_compile_code_string="Net Counter Incr: batch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["batch"]$;
counter=Network::batch;
update_after=0;
};
};
test {
expr="batch < max_batch";
};
};
DataSelectRowsProg @[2] {
desc="filter out trials when no response gated (these are just noise)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SelectRows: src table = trl_out_data dest table = trl_out_data comb_op = AND";
pre_compile_code_string="SelectRows: src table = trl_out_data dest table = trl_out_data comb_op = AND";
src_data_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["trl_out_data"]$$;
dest_data_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["trl_out_data"]$;
select_spec {
name="select_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataSelectEl;
el_def=0;
DataSelectEl @["minus_cycles_LESSTHAN__0"] {
col_name="minus_cycles";
name="minus_cycles_LESSTHAN__0";
on=1;
rel=LESSTHAN;
use_var=0;
cmp 2 0=150;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
};
comb_op=AND;
};
};
DataGroupProg @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Group from: src table = trl_out_data dest table = trl_group";
pre_compile_code_string="Group from: src table = trl_out_data dest table = trl_group";
src_data_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["trl_out_data"]$;
dest_data_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["trl_group"]$$;
group_spec {
name="group_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataGroupEl;
el_def=0;
DataGroupEl @["trial_name_GROUP_0"] {
col_name="trial_name";
name="trial_name_GROUP_0";
agg {name="AggregateSpec_50": op=GROUP: rel={name="Relation_50": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["batch_GROUP_1"] {
col_name="batch";
name="batch_GROUP_1";
agg {name="AggregateSpec_50": op=GROUP: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r1_MEAN_2"] {
col_name="r1";
name="r1_MEAN_2";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r2_MEAN_3"] {
col_name="r2";
name="r2_MEAN_3";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r3_MEAN_4"] {
col_name="r3";
name="r3_MEAN_4";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r4_MEAN_5"] {
col_name="r4";
name="r4_MEAN_5";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
};
append_agg_name=1;
};
};
DataGroupProg @[4] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Group from: src table = trl_group dest table = stats";
pre_compile_code_string="Group from: src table = trl_group dest table = stats";
src_data_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["trl_group"]$;
dest_data_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraBatch"].vars["stats"]$$;
group_spec {
name="group_spec";
ops {
name="ops";
el_typ=DataGroupEl;
el_def=0;
DataGroupEl @["trial_name_group_GROUP_0"] {
col_name="trial_name_group";
name="trial_name_group_GROUP_0";
agg {name="AggregateSpec_50": op=GROUP: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r1_mean_MEAN_1"] {
col_name="r1_mean";
name="r1_mean_MEAN_1";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r1_mean_SEM_2"] {
col_name="r1_mean";
name="r1_mean_SEM_2";
agg {name="AggregateSpec_50": op=SEM: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r2_mean_MEAN_3"] {
col_name="r2_mean";
name="r2_mean_MEAN_3";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r2_mean_SEM_4"] {
col_name="r2_mean";
name="r2_mean_SEM_4";
agg {name="AggregateSpec_50": op=SEM: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r3_mean_MEAN_5"] {
col_name="r3_mean";
name="r3_mean_MEAN_5";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r3_mean_SEM_6"] {
col_name="r3_mean";
name="r3_mean_SEM_6";
agg {name="AggregateSpec_50": op=SEM: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r4_mean_MEAN_7"] {
col_name="r4_mean";
name="r4_mean_MEAN_7";
agg {name="AggregateSpec_50": op=MEAN: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
DataGroupEl @["r4_mean_SEM_8"] {
col_name="r4_mean";
name="r4_mean_SEM_8";
agg {name="AggregateSpec_50": op=SEM: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
};
};
append_agg_name=1;
};
};
};
step_prog=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"]$$;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraTrain"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].doc$$;
};
};
name="LeabraTrain";
short_nm="Train";
tags="Leabra, Std";
desc="A complete training run of a Leabra network: iterating over epochs until the network has learned the task";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=RndSeed;
el_def=0;
RndSeed @["rnd_seed"] {
name="rnd_seed";
rnd_seed=1517222851;
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
DynEnumType @["RndInitType"] {
name="RndInitType";
desc=;
enums {
name=;
el_typ=DynEnumItem;
el_def=0;
DynEnumItem @["OLD_SEED"] {
name="OLD_SEED";
value=0;
desc="use stored random seed value (recreates same sequence every time)";
};
DynEnumItem @["NEW_SEED"] {
name="NEW_SEED";
value=1;
desc="generate new random seed (new sequence of random numbers)";
};
};
bits=0;
};
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to train";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["StdInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="datatable with training patterns";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["no_prompts"] {
name="no_prompts";
var_type=T_Bool;
bool_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="If train is called by other programs (e.g., Batch), they should set this to true -- otherwise it is reset to false in Init";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["max_epoch"] {
name="max_epoch";
var_type=T_Int;
int_val=60;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="maximum number of epochs to run for learning phase";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["max_epoch_reel"] {
name="max_epoch_reel";
var_type=T_Int;
int_val=60;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="epochs run in learning phase up to criterion of 5 epochs in a row without errors";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["train_mode"] {
name="train_mode";
var_type=T_HardEnum;
int_val=1;
hard_enum_type=Network::TrainMode;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="TRAIN = update weights (learn), TEST = just record network's responses but don't learn";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["test_mode"] {
name="test_mode";
var_type=T_HardEnum;
int_val=0;
hard_enum_type=Network::TrainMode;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="TRAIN = update weights (learn), TEST = just record network's responses but don't learn";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["rnd_init"] {
name="rnd_init";
var_type=T_DynEnum;
dyn_enum_val {
user_data_=NULL;
enum_type=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].types["RndInitType"]$$;
value=0;
};
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="how to initialize the random numbers when the Init button is pressed";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch"] {
name="epoch";
var_type=T_Int;
int_val=60;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="current epoch -- local copy, which is used to update network's epoch counter";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["inside_epoch"] {
name="inside_epoch";
var_type=T_Int;
int_val=59;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="current epoch -- local copy, which is used to update network's epoch counter";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["err_stopcrit"] {
name="err_stopcrit";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="stopping criterion -- when error measure (count of trials with a non-zero error by defult)
goes <= this value, stop training (set to -1 to disable stopping criterion, and always train to max_epoch epochs)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["rnd_seed"] {
name="rnd_seed";
var_type=T_Object;
object_type=RndSeed;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].objs["rnd_seed"]$$;
objs_ptr=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="random seed that is used at start of training -- if OldSeed is called";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Test"] {
name="Test";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="Transfer phase input data table";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["train_timer"] {
name="train_timer";
var_type=T_Object;
object_type=TimeUsed;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].train_time$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="records time used to train network (object lives on network -- this is a pointer to it)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["j"] {
name="j";
var_type=T_Int;
int_val=36;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["i"] {
name="i";
var_type=T_Int;
int_val=4;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["periode"] {
name="periode";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["num_intact_snc_units"] {
name="num_intact_snc_units";
var_type=T_Int;
int_val=4;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["snc_size"] {
name="snc_size";
var_type=T_Int;
int_val=4;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["SNc"] {
name="SNc";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["SNc"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["StdInputData"] {
name="StdInputData";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["StdInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["SuccessiveCor"] {
name="SuccessiveCor";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="Number of successive no error epochs to end learning phase";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d2"] {
name="d2";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraConSpec;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].specs.gp["Connections"]["SNc_Inhib_D2_"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d1"] {
name="d1";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraConSpec;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].specs.gp["Connections"]["Dopamine_D1_"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["inGo"] {
name="inGo";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraConSpec;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].specs.gp["Connections"]["Fixed"].children["InputStriatum"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="lr";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["inNoGO"] {
name="inNoGO";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraConSpec;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].specs.gp["Connections"]["Fixed"].children["inNoGO"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="lr";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="no_prompts = false";
pre_compile_code_string="no_prompts = false";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["no_prompts"]$$;
expr {
expr="false";
};
};
MethodCall @[1] {
desc="check network to make sure it is ready to be run";
flags=0;
code_string="network->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="network->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$$;
method=taBase::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
AssignExpr @[2] {
desc="get our pointer to the network training time object";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="train_timer = network.train_time";
pre_compile_code_string="train_timer = network.train_time";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["train_timer"]$$;
expr {
expr="network.train_time";
};
};
NetCounterInit @[3] {
desc="initialize epoch counter ";
flags=0;
code_string="Net Counter Init: epoch";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: epoch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
local_ctr_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["epoch"]$$;
counter=Network::epoch;
update_after=0;
};
If @[4] {
desc="initialize random seed (either old or new)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (rnd_init == OLD_SEED)";
pre_compile_code_string="if (rnd_init == OLD_SEED)";
cond {
expr="rnd_init == OLD_SEED";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="restore previous random seed (all runs produce same results)";
flags=0;
code_string="rnd_seed->OldSeed()";
pre_compile_code_string="rnd_seed->OldSeed()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["rnd_seed"]$$;
method=RndSeed::OldSeed;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void OldSeed()";
meth_desc=" restore current seed to random num generator";
};
};
};
Else @[5] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="new random numbers each time";
flags=0;
code_string="rnd_seed->NewSeed()";
pre_compile_code_string="rnd_seed->NewSeed()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["rnd_seed"]$;
method=RndSeed::NewSeed;
meth_args {
name="meth_args";
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void NewSeed()";
meth_desc=" set the seed to a new random value (based on time and process id)";
};
};
};
IfGuiPrompt @[6] {
desc="don't initialize weights without checking";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (gui && \"Do you want to Initialize Network Weights\")";
pre_compile_code_string="if (gui && \"Do you want to Initialize Network Weights\")";
prompt="Do you want to Initialize Network Weights";
yes_label="Yes";
no_label="No";
yes_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="initialize network weights: could also load pre-set weights or something else here";
flags=0;
code_string="network->Init_Weights()";
pre_compile_code_string="network->Init_Weights()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
method=Network::Init_Weights;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Init_Weights()";
meth_desc=" Initialize the weights -- also inits acts, counters and stats";
};
PrintExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Print network.name << \" Weights Initialized\"";
pre_compile_code_string="Print network.name << \" Weights Initialized\"";
expr {
expr="network.name << \" Weights Initialized\"";
};
debug=0;
};
};
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
LocalVars @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LocalVars (5 vars)";
pre_compile_code_string="LocalVars (5 vars)";
local_vars {
name="ProgVar_List_0";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["d2_acq"] {
name="d2_acq";
var_type=T_Real;
real_val=0.075;
flags=LOCAL_VAR|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d1_acq"] {
name="d1_acq";
var_type=T_Real;
real_val=0.6;
flags=LOCAL_VAR|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d2_perf"] {
name="d2_perf";
var_type=T_Real;
real_val=0.075;
flags=LOCAL_VAR|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d1_perf"] {
name="d1_perf";
var_type=T_Real;
real_val=0.6;
flags=LOCAL_VAR|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["d2_acq_4"] {
name="d2_acq_4";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=LOCAL_VAR|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="get our pointer to the network training time object";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="train_timer = network.train_time";
pre_compile_code_string="train_timer = network.train_time";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["train_timer"]$;
expr {
expr="network.train_time";
};
};
MethodCall @[2] {
desc="start timer to keep track of how long it takes to run entire training run";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="train_timer->StartTimer(true)";
pre_compile_code_string="train_timer->StartTimer(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["train_timer"]$;
method=TimeUsed::StartTimer;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_used";
required=0;
def_val="true";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void StartTimer(bool reset_used = true)";
meth_desc=" record the current time as the starting time, and optionally reset the time used information";
};
NetCounterInit @[3] {
desc="initialize epoch counter (both our local copy and network's epoch counter)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Init: epoch";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: epoch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["epoch"]$;
counter=Network::epoch;
update_after=0;
};
MemberAssign @[4] {
desc="set network's training mode to our local value";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.train_mode = train_mode";
pre_compile_code_string="network.train_mode = train_mode";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
path="train_mode";
expr {
expr="train_mode";
};
update_after=0;
};
If @[5] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (no_prompts)";
pre_compile_code_string="if (no_prompts)";
cond {
expr="no_prompts";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="initialize network weights: could also load pre-set weights or something else here";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Init_Weights()";
pre_compile_code_string="network->Init_Weights()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
method=Network::Init_Weights;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Init_Weights()";
meth_desc=" Initialize the weights -- also inits acts, counters and stats";
};
PrintExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Print network.name << \" Weights Initialized\"";
pre_compile_code_string="Print network.name << \" Weights Initialized\"";
expr {
expr="network.name << \" Weights Initialized\"";
};
debug=0;
};
};
};
AssignExpr @[6] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="snc_size = SNc.units.size";
pre_compile_code_string="snc_size = SNc.units.size";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["snc_size"]$$;
expr {
expr="SNc.units.size";
};
};
OtherProgramVar @[7] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=num_intact_snc_units var_2=? var_3=? var_4=? ";
pre_compile_code_string="Vars To: program=DA_Rew_Punish set=to var_1=num_intact_snc_units var_2=? var_3=? var_4=? ";
other_prog=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"]$;
set_other=1;
var_1=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["num_intact_snc_units"]$;
var_2=NULL;
var_3=NULL;
var_4=NULL;
};
AssignExpr @[8] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="periode = 0";
pre_compile_code_string="periode = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["periode"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
AssignExpr @[9] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="max_epoch_reel = max_epoch";
pre_compile_code_string="max_epoch_reel = max_epoch";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["max_epoch_reel"]$$;
expr {
expr="max_epoch";
};
};
MemberAssign @[10] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="d2.wt_scale.abs = d2_acq";
pre_compile_code_string="d2.wt_scale.abs = d2_acq";
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["d2"]$$;
path="wt_scale.abs";
expr {
expr="d2_acq";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[11] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="d1.wt_scale.abs = d1_acq";
pre_compile_code_string="d1.wt_scale.abs = d1_acq";
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["d1"]$$;
path="wt_scale.abs";
expr {
expr="d1_acq";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[12] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="inGo.lrate = 0.05";
pre_compile_code_string="inGo.lrate = 0.05";
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["inGo"]$$;
path="lrate";
expr {
expr="0.05";
};
update_after=1;
};
MemberAssign @[13] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="inNoGO.lrate = 0.05";
pre_compile_code_string="inNoGO.lrate = 0.05";
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["inNoGO"]$$;
path="lrate";
expr {
expr="0.05";
};
update_after=1;
};
WhileLoop @[14] {
desc="main loop over epochs of training";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="while (epoch < 0.5*max_epoch)";
pre_compile_code_string="while (epoch < 0.5*max_epoch)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set network's training mode to our local value";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.train_mode = train_mode";
pre_compile_code_string="network.train_mode = train_mode";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
path="train_mode";
expr {
expr="train_mode";
};
update_after=0;
};
AssignExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="inside_epoch = epoch";
pre_compile_code_string="inside_epoch = epoch";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["inside_epoch"]$$;
expr {
expr="epoch";
};
};
ProgramCall @[2] {
desc="run the epoch program (one epoch), passes our network and input_data";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraEpoch(network, periode, FlatNetwork, input_data)";
pre_compile_code_string="LeabraEpoch(network, periode, FlatNetwork, input_data)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="periode";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="periode";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
ProgArg @[3] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"]$$;
targ_ld_init="*LeabraEpoch*";
};
NetCounterIncr @[3] {
desc="increment the epoch counter (locally and on network)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Incr: epoch";
pre_compile_code_string="Net Counter Incr: epoch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["epoch"]$;
counter=Network::epoch;
update_after=0;
};
If @[4] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.cnt_err <= err_stopcrit)";
pre_compile_code_string="if (network.cnt_err <= err_stopcrit)";
cond {
expr="network.cnt_err <= err_stopcrit";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="Compter le nombre d'epoques correctes successives";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SuccessiveCor = SuccessiveCor+1";
pre_compile_code_string="SuccessiveCor = SuccessiveCor+1";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["SuccessiveCor"]$$;
expr {
expr="SuccessiveCor+1";
};
};
};
};
Else @[5] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SuccessiveCor = 0";
pre_compile_code_string="SuccessiveCor = 0";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["SuccessiveCor"]$;
expr {
expr="0";
};
};
};
};
MemberAssign @[6] {
desc="set network's training mode to our local value";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.train_mode = test_mode";
pre_compile_code_string="network.train_mode = test_mode";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
path="train_mode";
expr {
expr="test_mode";
};
update_after=0;
};
};
test {
expr="epoch < 0.5*max_epoch";
};
};
MemberAssign @[15] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="d2.wt_scale.abs = d2_perf";
pre_compile_code_string="d2.wt_scale.abs = d2_perf";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["d2"]$;
path="wt_scale.abs";
expr {
expr="d2_perf";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[16] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="d1.wt_scale.abs = d1_perf";
pre_compile_code_string="d1.wt_scale.abs = d1_perf";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["d1"]$;
path="wt_scale.abs";
expr {
expr="d1_perf";
};
update_after=0;
};
WhileLoop @[17] {
desc="main loop over epochs of training";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="while (epoch < max_epoch)";
pre_compile_code_string="while (epoch < max_epoch)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set network's training mode to our local value";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.train_mode = test_mode";
pre_compile_code_string="network.train_mode = test_mode";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
path="train_mode";
expr {
expr="test_mode";
};
update_after=0;
};
AssignExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="inside_epoch = epoch";
pre_compile_code_string="inside_epoch = epoch";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["inside_epoch"]$;
expr {
expr="epoch";
};
};
ProgramCall @[2] {
desc="run the epoch program (one epoch), passes our network and input_data";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraEpoch(network, periode, FlatNetwork, Test)";
pre_compile_code_string="LeabraEpoch(network, periode, FlatNetwork, Test)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="periode";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="periode";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
ProgArg @[3] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="Test";
};
};
};
target=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"]$;
targ_ld_init="*LeabraEpoch*";
};
NetCounterIncr @[3] {
desc="increment the epoch counter (locally and on network)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Incr: epoch";
pre_compile_code_string="Net Counter Incr: epoch";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["epoch"]$;
counter=Network::epoch;
update_after=0;
};
MemberAssign @[4] {
desc="set network's training mode to our local value";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.train_mode = test_mode";
pre_compile_code_string="network.train_mode = test_mode";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].args["network"]$;
path="train_mode";
expr {
expr="test_mode";
};
update_after=0;
};
};
test {
expr="epoch < max_epoch";
};
};
MethodCall @[18] {
desc="stop the timer -- time elapsed is now recorded in this object, and can be displayed or recorded to a data table";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="train_timer->EndTimer()";
pre_compile_code_string="train_timer->EndTimer()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrain"].vars["train_timer"]$;
method=TimeUsed::EndTimer;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void EndTimer()";
meth_desc=" record the current time as the ending time, and compute difference as the time used";
};
};
step_prog=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"]$;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraEpoch"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].doc$$;
};
};
name="LeabraEpoch";
short_nm="Epoch";
tags="Leabra, Std";
desc="iterates over all of the items in a data table and calls LeabraTrial process on them";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["periode"] {
name="periode";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="current experimental phase: 0 = learning, 1 = transfer, 2 = new overlap, 3 = new incongruent, 4 = asymptotic noisy";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="table of patterns to present to the network, one row at a time";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["data_loop_order"] {
name="data_loop_order";
var_type=T_HardEnum;
int_val=1;
hard_enum_type=DataLoop::Order;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="controls the order in which events (rows of the input data datatable) are presented to the network
(SEQUENTIAL, PERMUTED, RANDOM)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["trial"] {
name="trial";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="current trial (event) within the epoch -- increments automatically";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["trial_mon_data"] {
name="trial_mon_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["TrialOutputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="trial-level output data -- we reset it every epoch by default, so it just contains last epoch of data";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_timer"] {
name="epoch_timer";
var_type=T_Object;
object_type=TimeUsed;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].epoch_time$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="timer to record time required to perform one epoch of processing (object is on network -- this is a pointer to it)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["data_loop_index"] {
name="data_loop_index";
var_type=T_Int;
int_val=2;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="index counter for the looping over items in the input_data datatable (not always the same as trial counter, depending on distributed memory computation)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["NLoops"] {
name="NLoops";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="batch counter";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize trial counter (local variable and in the network)";
flags=0;
code_string="Net Counter Init: trial";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: trial";
network_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["network"]$$;
local_ctr_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["trial"]$$;
counter=Network::trial;
update_after=0;
};
AssignExpr @[1] {
desc="get pointer to epoch timer object on network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["epoch_timer"]$$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize trial counter (local variable and in the network)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Init: trial";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: trial";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["trial"]$;
counter=Network::trial;
update_after=0;
};
AssignExpr @[1] {
desc="get pointer to epoch timer object on network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["epoch_timer"]$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
MethodCall @[2] {
desc="start the epoch timer to record computation time per epoch";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer->StartTimer(true)";
pre_compile_code_string="epoch_timer->StartTimer(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["epoch_timer"]$;
method=TimeUsed::StartTimer;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_used";
required=0;
def_val="true";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void StartTimer(bool reset_used = true)";
meth_desc=" record the current time as the starting time, and optionally reset the time used information";
};
MethodCall @[3] {
desc="reset trial-level monitor data every epoch, so it reflects only the most recent epoch's worth of data (turn flags OFF to accumulate trial data across entire training run)";
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="trial_mon_data->ResetData()";
pre_compile_code_string="trial_mon_data->ResetData()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["trial_mon_data"]$$;
method=DataTable::ResetData;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void ResetData()";
meth_desc=" deletes all the data (rows), but keeps the column structure -- this cannot be undone!";
};
NetDataLoop @[4] {
desc="iterates over the events/rows of input_data, according to data_loop_order variable";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Data Loop (PERMUTED): table=input_data index=data_loop_index order_var=data_loop_order ";
pre_compile_code_string="Net Data Loop (PERMUTED): table=input_data index=data_loop_index order_var=data_loop_order ";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ProgramCall @[0] {
desc="run the trial program, passing network and input_data";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraTrial(network, input_data, FlatNetwork)";
pre_compile_code_string="LeabraTrial(network, input_data, FlatNetwork)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"]$$;
targ_ld_init="*LeabraTrial*";
};
If @[1] {
desc="test if it is time to update the weight values from delta weights (dWt) computed over trials";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.Compute_Weights_Test(trial+1))";
pre_compile_code_string="if (network.Compute_Weights_Test(trial+1))";
cond {
expr="network.Compute_Weights_Test(trial+1)";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="update the weight values based on changes computed by trial program";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Compute_Weights()";
pre_compile_code_string="network->Compute_Weights()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["network"]$;
method=Network::Compute_Weights;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Compute_Weights()";
meth_desc=" update weights for whole net: calls DMem_SumDWts before doing update if in dmem mode";
};
};
};
};
data_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["input_data"]$$;
index_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["data_loop_index"]$$;
order_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["data_loop_order"]$$;
order=PERMUTED;
update_after=0;
dmem_nprocs=1;
dmem_this_proc=0;
grouped=0;
group_col 9 0="Group";
group_index_var=NULL;
group_order_var=NULL;
group_order=PERMUTED;
group_idx_list{ };
};
If @[5] {
desc="if full batch mode, update only at end of epoch";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.wt_update == Network::BATCH)";
pre_compile_code_string="if (network.wt_update == Network::BATCH)";
cond {
expr="network.wt_update == Network::BATCH";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="final update of weights based on accumulated changes";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Compute_Weights()";
pre_compile_code_string="network->Compute_Weights()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["network"]$;
method=Network::Compute_Weights;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Compute_Weights()";
meth_desc=" update weights for whole net: calls DMem_SumDWts before doing update if in dmem mode";
};
};
};
MethodCall @[6] {
desc="network accumulates some core statistics over the epoch -- this finalizes that process and computes summary stats";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Compute_EpochStats()";
pre_compile_code_string="network->Compute_EpochStats()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Compute_EpochStats;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Compute_EpochStats()";
meth_desc=" compute epoch-level statistics; calls DMem_ComputeAggs (if dmem) and EpochSSE -- specific algos may add more compute epoch-level statistics, including SSE, AvgExtRew and AvgCycles";
};
ProgramCall @[7] {
desc="run program that records data from network and possibly other sources about the epoch";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraEpochMonitor_10(network, FlatNetwork)";
pre_compile_code_string="LeabraEpochMonitor_10(network, FlatNetwork)";
prog_args {
name="ProgArg_List_0";
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=Network;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"]$$;
targ_ld_init="*LeabraEpochMonitor*";
};
MethodCall @[8] {
desc="done with the computation in the epoch -- record time it took";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer->EndTimer()";
pre_compile_code_string="epoch_timer->EndTimer()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpoch"].vars["epoch_timer"]$;
method=TimeUsed::EndTimer;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void EndTimer()";
meth_desc=" record the current time as the ending time, and compute difference as the time used";
};
};
step_prog=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"]$;
step_n=5;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraTrial"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].doc$$;
};
};
name="LeabraTrial";
short_nm="Trial";
tags="Leabra, Std";
desc="Leabra processing of a single input/toutput event or external information: typically runs a minus and a plus phase, then learns (unless testing)";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- typically set by higher-level calling programs";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="datatable containing training input/output patterns";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["phase_no"] {
name="phase_no";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="local phase counting variable (0 is typically minus phase, 1 is typically plus -- depends on network settings)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["update_net_view"] {
name="update_net_view";
var_type=T_Bool;
bool_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="determines whether to update any network view displays after trial is completed";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["NLoops"] {
name="NLoops";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="batch counter";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM0"] {
name="actM0";
var_type=T_Real;
real_val=0.00304851122200489;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Motor_Cortex"] {
name="Motor_Cortex";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["PMC"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM1"] {
name="actM1";
var_type=T_Real;
real_val=0.1971741318702698;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM2"] {
name="actM2";
var_type=T_Real;
real_val=0.8771076202392578;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM3"] {
name="actM3";
var_type=T_Real;
real_val=0.002235397696495056;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM4"] {
name="actM4";
var_type=T_Real;
real_val=0.0004378691664896905;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM5"] {
name="actM5";
var_type=T_Real;
real_val=0.3188992142677307;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM6"] {
name="actM6";
var_type=T_Real;
real_val=0.8478431105613708;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM7"] {
name="actM7";
var_type=T_Real;
real_val=0.001403427799232304;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["action"] {
name="action";
var_type=T_Int;
int_val=3;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["r1"] {
name="r1";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["r2"] {
name="r2";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["r3"] {
name="r3";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["r4"] {
name="r4";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Output"] {
name="Output";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["Output"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize the local phase_no counter, and corresponding network one";
flags=0;
code_string="Net Counter Init: phase_no";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: phase_no";
network_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$$;
local_ctr_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["phase_no"]$$;
counter=LeabraNetwork::phase_no;
update_after=0;
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize the local phase_no counter, and corresponding network one";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Init: phase_no";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: phase_no";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["phase_no"]$;
counter=LeabraNetwork::phase_no;
update_after=0;
};
MethodCall @[1] {
desc="initializes various counters at start of trial";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Trial_Init()";
pre_compile_code_string="network->Trial_Init()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Trial_Init;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Trial_Init()";
meth_desc=" initialize at start of trial (SetCurLrate, set phase_max, Decay state)";
};
WhileLoop @[2] {
desc="loop over phases of settling in the network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="while (phase_no < network.phase_max)";
pre_compile_code_string="while (phase_no < network.phase_max)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ProgramCall @[0] {
desc="run the settle program (which iterates over cyles of network activation updating) for each phase";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraSettle(network, FlatNetwork, input_data)";
pre_compile_code_string="LeabraSettle(network, FlatNetwork, input_data)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="FlatNetwork";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
};
target=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"]$;
targ_ld_init="*LeabraSettle*";
};
NetCounterIncr @[1] {
desc="increment the phase number (also on network)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Incr: phase_no";
pre_compile_code_string="Net Counter Incr: phase_no";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["phase_no"]$;
counter=LeabraNetwork::phase_no;
update_after=0;
};
MethodCall @[2] {
desc="increments other phase state information to prepare for the next phase of settling";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Trial_UpdatePhase()";
pre_compile_code_string="network->Trial_UpdatePhase()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Trial_UpdatePhase;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Trial_UpdatePhase()";
meth_desc=" update phase based on phase_no -- typically called by program in Trial loop over settling";
};
};
test {
expr="phase_no < network.phase_max";
};
};
AssignExpr @[3] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM0 = Motor_Cortex.units[0].act_m";
pre_compile_code_string="actM0 = Motor_Cortex.units[0].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM0"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[0].act_m";
};
};
AssignExpr @[4] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM1 = Motor_Cortex.units[1].act_m";
pre_compile_code_string="actM1 = Motor_Cortex.units[1].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM1"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[1].act_m";
};
};
AssignExpr @[5] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM2 = Motor_Cortex.units[2].act_m";
pre_compile_code_string="actM2 = Motor_Cortex.units[2].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM2"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[2].act_m";
};
};
AssignExpr @[6] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM3 = Motor_Cortex.units[3].act_m";
pre_compile_code_string="actM3 = Motor_Cortex.units[3].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM3"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[3].act_m";
};
};
AssignExpr @[7] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM4 = Motor_Cortex.units[4].act_m";
pre_compile_code_string="actM4 = Motor_Cortex.units[4].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM4"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[4].act_m";
};
};
AssignExpr @[8] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM5 = Motor_Cortex.units[5].act_m";
pre_compile_code_string="actM5 = Motor_Cortex.units[5].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM5"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[5].act_m";
};
};
AssignExpr @[9] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM6 = Motor_Cortex.units[6].act_m";
pre_compile_code_string="actM6 = Motor_Cortex.units[6].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM6"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[6].act_m";
};
};
AssignExpr @[10] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM7 = Motor_Cortex.units[7].act_m";
pre_compile_code_string="actM7 = Motor_Cortex.units[7].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["actM7"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[7].act_m";
};
};
AssignExpr @[11] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 0";
pre_compile_code_string="action = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["action"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
AssignExpr @[12] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r1 = 0";
pre_compile_code_string="r1 = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r1"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
AssignExpr @[13] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r2 = 0";
pre_compile_code_string="r2 = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r2"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
AssignExpr @[14] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r3 = 0";
pre_compile_code_string="r3 = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r3"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
AssignExpr @[15] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r4 = 0";
pre_compile_code_string="r4 = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r4"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
If @[16] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Output.acts.max >0)";
pre_compile_code_string="if (Output.acts.max >0)";
cond {
expr="Output.acts.max >0";
};
true_code {
name="ProgEl_List_190";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 1";
pre_compile_code_string="action = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["action"]$;
expr {
expr="1";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r1 = 1";
pre_compile_code_string="r1 = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r1"]$;
expr {
expr="1";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 2";
pre_compile_code_string="action = 2";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["action"]$;
expr {
expr="2";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r2 = 1";
pre_compile_code_string="r2 = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r2"]$;
expr {
expr="1";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 3";
pre_compile_code_string="action = 3";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["action"]$;
expr {
expr="3";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r3 = 1";
pre_compile_code_string="r3 = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r3"]$;
expr {
expr="1";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 4";
pre_compile_code_string="action = 4";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["action"]$;
expr {
expr="4";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="r4 = 1";
pre_compile_code_string="r4 = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r4"]$;
expr {
expr="1";
};
};
};
};
};
};
};
};
};
};
MethodCall @[17] {
desc="after the trial is over, do final computations: Compute_dWt (learn weights), compute stats";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Trial_Final()";
pre_compile_code_string="network->Trial_Final()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Trial_Final;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Trial_Final()";
meth_desc=" do final processing after trial (Compute_dWt, EncodeState)";
};
ProgramCall @[18] {
desc="records data about the trial-level processing to a datatable for graphing/processing";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraTrialMonitor(network)";
pre_compile_code_string="LeabraTrialMonitor(network)";
prog_args {
name="ProgArg_List_0";
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=Network;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"]$$;
targ_ld_init="*LeabraTrialMonitor*";
};
NetUpdateView @[19] {
desc="update the network view(s) (only if update_net_view is true)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Update View";
pre_compile_code_string="Net Update View";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].args["network"]$;
update_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["update_net_view"]$$;
};
};
step_prog=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"]$$;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraSettle"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].doc$$;
};
};
name="LeabraSettle";
short_nm="Settle";
tags="Leabra, Std";
desc="iterates over cycles of updating until network has settled into a stable state, or output activations have exceeded a threshold";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["cycle"] {
name="cycle";
var_type=T_Int;
int_val=130;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="current cycle of settling (local loop counter)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["min_cycles"] {
name="min_cycles";
var_type=T_Int;
int_val=15;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="IMPORTANT: this value is obtained from the network min_cycles and min_cycles_phase2 -- change the value on the network object, not here in this program!
sets the minimum number of cycles to settle for, regardless of network state changes, etc";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["update_net_view"] {
name="update_net_view";
var_type=T_Bool;
bool_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="if true, will update network views at end of settling";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Output"] {
name="Output";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["Output"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Thal"] {
name="Thal";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["Thalamus"]$$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["NLoops"] {
name="NLoops";
var_type=T_Int;
int_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="batch counter";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize local cycle counter and corresponding counter on network";
flags=0;
code_string="Net Counter Init: cycle";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: cycle";
network_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$$;
local_ctr_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["cycle"]$$;
counter=Network::cycle;
update_after=0;
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
NetCounterInit @[0] {
desc="initialize local cycle counter and corresponding counter on network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Init: cycle";
pre_compile_code_string="Net Counter Init: cycle";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["cycle"]$;
counter=Network::cycle;
update_after=0;
};
AssignExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Output = network.layers.Output";
pre_compile_code_string="Output = network.layers.Output";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["Output"]$$;
expr {
expr="network.layers.Output";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Thal = network.layers.Thalamus";
pre_compile_code_string="Thal = network.layers.Thalamus";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["Thal"]$$;
expr {
expr="network.layers.Thalamus";
};
};
MethodCall @[3] {
desc="resets input data, before getting new external inputs data from apply inputs call";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Init_InputData()";
pre_compile_code_string="network->Init_InputData()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
method=Network::Init_InputData;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Init_InputData()";
meth_desc=" Initializes external and target inputs";
};
ProgramCall @[4] {
desc="apply external input activations from the input_data table to the network
this program can be extended to do arbitrary things to generate data and apply it to network layers";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="ApplyInput1(FlatNetwork, input_data)";
pre_compile_code_string="ApplyInput1(FlatNetwork, input_data)";
prog_args {
name="ProgArg_List_0";
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=Network;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="FlatNetwork";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"]$$;
targ_ld_init="*ApplyInput1*";
};
ProgramCall @[5] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="DA_Rew_Punish(network, input_data)";
pre_compile_code_string="DA_Rew_Punish(network, input_data)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=DataTable;
type="DataTable*";
name="input_data";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
};
target=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"]$;
targ_ld_init="*DA_Rew_Punish*";
};
If @[6] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase == LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
pre_compile_code_string="if (network.phase == LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
cond {
expr="network.phase == LeabraNetwork::PLUS_PHASE";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.cycle_max = 30";
pre_compile_code_string="network.cycle_max = 30";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
path="cycle_max";
expr {
expr="30";
};
update_after=0;
};
};
};
Else @[7] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="number of cycles to run in minus phase";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network.cycle_max = 150";
pre_compile_code_string="network.cycle_max = 150";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
path="cycle_max";
expr {
expr="150";
};
update_after=0;
};
};
};
MethodCall @[8] {
desc="initializes various counters at start of settling";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Settle_Init()";
pre_compile_code_string="network->Settle_Init()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Settle_Init;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Settle_Init()";
meth_desc=" initialize network for settle-level processing (decay, active k, hard clamp, netscale)";
};
If @[9] {
desc="get appropriate min_cycles value depending on which phase we're in";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase_no <= 1)";
pre_compile_code_string="if (network.phase_no <= 1)";
cond {
expr="network.phase_no <= 1";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="get minimum number of cycles from parameter on network (which is where you should change this value!)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="min_cycles = network.min_cycles";
pre_compile_code_string="min_cycles = network.min_cycles";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["min_cycles"]$$;
expr {
expr="network.min_cycles";
};
};
};
};
Else @[10] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="get minimum number of cycles from parameter on network (which is where you should change this value!)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="min_cycles = network.min_cycles_phase2";
pre_compile_code_string="min_cycles = network.min_cycles_phase2";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["min_cycles"]$;
expr {
expr="network.min_cycles_phase2";
};
};
};
};
WhileLoop @[11] {
desc="the main loop over cycles of updating";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="while (cycle < network.cycle_max)";
pre_compile_code_string="while (cycle < network.cycle_max)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ProgramCall @[0] {
desc="run the cycle program, which computes one cycle of activations";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LeabraCycle(network)";
pre_compile_code_string="LeabraCycle(network)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=LeabraNetwork;
type="LeabraNetwork*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
target=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"]$;
targ_ld_init="*LeabraCycle*";
};
NetCounterIncr @[1] {
desc="increment cycle counter (also on network)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Counter Incr: cycle";
pre_compile_code_string="Net Counter Incr: cycle";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
local_ctr_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["cycle"]$;
counter=Network::cycle;
update_after=0;
};
IfContinue @[2] {
desc="avoid subsequent stopping criteria if below min_cycles";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if(cycle < min_cycles) continue";
pre_compile_code_string="if(cycle < min_cycles) continue";
cond {
expr="cycle < min_cycles";
};
};
IfBreak @[3] {
desc="stop settling when thal unit is 50% active (so average thal = .25)";
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.avg > .25)&(Thal.acts.avg > .25)) break";
pre_compile_code_string="if((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.avg > .25)&(Thal.acts.avg > .25)) break";
cond {
expr="(network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.avg > .25)&(Thal.acts.avg > .25)";
};
};
If @[4] {
desc=;
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if ((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5))";
pre_compile_code_string="if ((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5))";
cond {
expr="(network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5)";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
PrintExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Print Output.acts.max";
pre_compile_code_string="Print Output.acts.max";
expr {
expr="Output.acts.max";
};
debug=0;
};
PrintExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Print Thal.acts.max";
pre_compile_code_string="Print Thal.acts.max";
expr {
expr="Thal.acts.max";
};
debug=0;
};
};
};
IfBreak @[5] {
desc="stop settling when thal unit is 50% active (so average thal = .25)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5)) break";
pre_compile_code_string="if((network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5)) break";
cond {
expr="(network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)&(Output.acts.max > .5)&(Thal.acts.max > .5)";
};
};
IfBreak @[6] {
desc="stopping criterion for settling: based either on maximum change in activation (maxda) or on the maximum activation value in the network getting over threshold (which ever comes first). Set either parmeter to values that are always false (e.g., trg_max_act_stopcrit = -1) to eliminate associated source of criterion for stopping settling.";
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if((network.maxda < network.maxda_stopcrit) ||
(network.trg_max_act > network.trg_max_act_stopcrit)) break";
pre_compile_code_string="if((network.maxda < network.maxda_stopcrit) ||
(network.trg_max_act > network.trg_max_act_stopcrit)) break";
cond {
expr="(network.maxda < network.maxda_stopcrit) ||
(network.trg_max_act > network.trg_max_act_stopcrit)";
};
};
};
test {
expr="cycle < network.cycle_max";
};
};
MethodCall @[12] {
desc="perform final operations at end of settling (storing final activations, etc)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Settle_Final()";
pre_compile_code_string="network->Settle_Final()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Settle_Final;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Settle_Final()";
meth_desc=" do final processing after settling (postsettle, Compute_dWt if needed)";
};
If @[13] {
desc="only run trial-level statistics in minus phase (otherwise network may have correct answer clamped on!). IMPORTANT: this assumes that you've got target activation values for output layers already
presented in the minus phase -- if this is not the case (values are computed on the fly), you may want to run this instead at the start of the plus phase, after ApplyInputs";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)";
pre_compile_code_string="if (network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE)";
cond {
expr="network.phase == LeabraNetwork::MINUS_PHASE";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="compute trial-level statistics";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Compute_TrialStats()";
pre_compile_code_string="network->Compute_TrialStats()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Compute_TrialStats;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Compute_TrialStats()";
meth_desc=" compute trial-level statistics (SSE and others defined by specific algorithms) compute trial-level statistics, including SSE and minus cycles -- to be called at end of minus phase -- use Compute_TrialStats_Test() to determine when -- HOWEVER: it is much better to call Compute_PhaseStats(), which calls Compute_MinusStats() and Compute_PlustStats() separately at end of each phase (respectively) to get the appropriate stats at each point";
};
};
};
If @[14] {
desc="this stat must be called in plus phase when reward information is avail";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase_no == 1)";
pre_compile_code_string="if (network.phase_no == 1)";
cond {
expr="network.phase_no == 1";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="get external reward information";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Compute_ExtRew()";
pre_compile_code_string="network->Compute_ExtRew()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
method=LeabraNetwork::Compute_ExtRew;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Compute_ExtRew()";
meth_desc=" compute external reward information: Must be called in plus phase (phase_no == 1)";
};
};
};
NetUpdateView @[15] {
desc="update network views, if update_net_view == true";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Update View";
pre_compile_code_string="Net Update View";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].args["network"]$;
update_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraSettle"].vars["update_net_view"]$$;
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraCycle"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"].doc$$;
};
};
name="LeabraCycle";
short_nm="Cycle";
tags="Leabra, Std";
desc="runs one cycle of leabra processing (updating net inputs and activations)";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["update_net_view"] {
name="update_net_view";
var_type=T_Bool;
bool_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="determines whether network views will be updated on a cycle-by-cycle basis (slow, but often quite useful for seeing how processing is proceeding)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["i"] {
name="i";
var_type=T_Int;
int_val=12;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="this does all the standard leabra processing for one cycle of activation updating";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->Cycle_Run()";
pre_compile_code_string="network->Cycle_Run()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"].args["network"]$$;
method=LeabraNetwork::Cycle_Run;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void Cycle_Run()";
meth_desc=" compute one cycle of updating: netinput, inhibition, activations";
};
NetUpdateView @[1] {
desc="update network views if update_net_view == true";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Net Update View";
pre_compile_code_string="Net Update View";
network_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"].args["network"]$;
update_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraCycle"].vars["update_net_view"]$$;
};
If @[2] {
desc="apply phasic DA in plus phase";
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
pre_compile_code_string="if (network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
cond {
expr="network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < 12; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < 12; i++)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="object.units[i].act = InputHidden.units[i].act_m";
pre_compile_code_string="object.units[i].act = InputHidden.units[i].act_m";
obj=NULL;
path="units[i].act";
expr {
expr="InputHidden.units[i].act_m";
};
update_after=1;
};
PrintExpr @[1] {
desc=;
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Print \"boum\"";
pre_compile_code_string="Print \"boum\"";
expr {
expr="\"boum\"";
};
debug=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < 12";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
Else @[3] {
desc=;
flags=OFF|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < 1; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < 1; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < 1";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
ProgramCall @[4] {
desc=;
flags=OFF|NON_STD|CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Cycle_Monitor(network)";
pre_compile_code_string="Cycle_Monitor(network)";
prog_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=Network;
type="Network*";
name="network";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
target=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"]$$;
targ_ld_init="*Cycle_Monitor*";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=5;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["ApplyInput1"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].doc$$;
};
};
name="ApplyInput1";
short_nm="pplynp";
tags="Network, InputData, Apply";
desc="apply the current input data to the network as external input and target values";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=LayerWriter;
el_def=0;
LayerWriter @["LayerWriter_0"] {
name="LayerWriter_0";
data=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
network=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
layer_data {
name="layer_data";
el_typ=LayerWriterEl;
el_def=0;
LayerWriterEl @[0] {
col_name="Input";
net_target=LAYER;
layer_name="Input";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=1;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=EXT;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
LayerWriterEl @[1] {
col_name="Output";
net_target=LAYER;
layer_name="Output";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=1;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=TARG;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
LayerWriterEl @[2] {
col_name="SNc";
net_target=LAYER;
layer_name="SNc";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=1;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=EXT;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
LayerWriterEl @[3] {
col_name="Motor_Cortex";
net_target=LAYER;
layer_name="PMC";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=0;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=COMP;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
LayerWriterEl @[4] {
col_name="Name";
net_target=TRIAL_NAME;
layer_name="Name";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=1;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=0;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
LayerWriterEl @[5] {
col_name="Context";
net_target=LAYER;
layer_name="Context";
offset {x=0: y=0: };
use_layer_type=1;
quiet=0;
na_by_range=0;
ext_flags=EXT;
noise {name="noise": type=NONE: mean=0: var=0.5: par=1: };
};
};
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to apply inputs to -- typically set by calling program";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="input datatable containing input/output patterns";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["LayerWriter_0"] {
name="LayerWriter_0";
var_type=T_Object;
object_type=LayerWriter;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].objs["LayerWriter_0"]$$;
objs_ptr=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="this is a pointer to the LayerWriter object in objs -- edit that object to determine how information is presented to the network";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="sets the datatable and network for the layer writer, so it knows what to write to";
flags=0;
code_string="LayerWriter_0->SetDataNetwork(input_data, network)";
pre_compile_code_string="LayerWriter_0->SetDataNetwork(input_data, network)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].vars["LayerWriter_0"]$$;
method=LayerWriter::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="db";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* db, Network* net)";
meth_desc=" set the data table and network pointers -- convenience function for programs ";
};
MethodCall @[1] {
desc="check the configuration of the layer writer -- will emit warnings and errors for missing or misconfigured items";
flags=0;
code_string="LayerWriter_0->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="LayerWriter_0->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].vars["LayerWriter_0"]$;
method=taList_impl::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="sets the datatable and network for the layer writer, so it knows what to write to";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LayerWriter_0->SetDataNetwork(input_data, network)";
pre_compile_code_string="LayerWriter_0->SetDataNetwork(input_data, network)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].vars["LayerWriter_0"]$;
method=LayerWriter::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="db";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="input_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* db, Network* net)";
meth_desc=" set the data table and network pointers -- convenience function for programs ";
};
MethodCall @[1] {
desc="apply inputs to the network! layer writer has all the key specs";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="LayerWriter_0->ApplyInputData()";
pre_compile_code_string="LayerWriter_0->ApplyInputData()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["ApplyInput1"].vars["LayerWriter_0"]$;
method=LayerWriter::ApplyInputData;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="bool ApplyInputData()";
meth_desc=" apply data to the layers, using the network's current context settings (TEST,TRAIN,etc) -- returns success";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraTrialMonitor"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].doc$$;
};
};
name="LeabraTrialMonitor";
short_nm="TrMntF";
tags="Leabra, Std, Monitor";
desc="monitor trial-level data from the network (and potentially other sources) -- stores results in datatable (TrialOutputData typically) that can be used for graph/grid views and further analysis ";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=NetMonitor;
el_def=0;
NetMonitor @["trial_netmon"] {
name="trial_netmon";
items {
name="items";
el_typ=NetMonItem;
el_def=0;
NetMonItem @["batch"] {
name="batch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="batch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["epoch"] {
name="epoch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="epoch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["trial_name"] {
name="trial_name";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="trial_name";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["minus_cycles"] {
name="minus_cycles";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="minus_cycles";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["r1"] {
name="r1";
computed=0;
object_type=ProgVar;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r1"]$;
variable="int_val";
var_label=;
name_style=MY_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["r2"] {
name="r2";
computed=0;
object_type=ProgVar;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r2"]$;
variable="int_val";
var_label=;
name_style=MY_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["r3"] {
name="r3";
computed=0;
object_type=ProgVar;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r3"]$;
variable="int_val";
var_label=;
name_style=MY_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["r4"] {
name="r4";
computed=0;
object_type=ProgVar;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrial"].vars["r4"]$;
variable="int_val";
var_label=;
name_style=MY_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
};
network=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
data=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["TrialOutputData"]$;
rmv_orphan_cols=1;
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to record data from";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["trial_mon_data"] {
name="trial_mon_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["TrialOutputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="data table to record trial-level data to (this program writes new data to this table!)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["trial_netmon"] {
name="trial_netmon";
var_type=T_Object;
object_type=NetMonitor;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].objs["trial_netmon"]$$;
objs_ptr=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="pointer to the NetMonitor object in objs secton of this program that contains configuration for what to record and where to get it";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="set the network and datatable for the NetMonitor";
flags=0;
code_string="trial_netmon->SetDataNetwork(trial_mon_data, network)";
pre_compile_code_string="trial_netmon->SetDataNetwork(trial_mon_data, network)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_netmon"]$$;
method=NetMonitor::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="trial_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* dt, Network* net)";
meth_desc=" set both the data table and network -- convenient for programs -- calls ResetDataTableCols too -- don't call if columns are manually added or this is adding additional rows to a table";
};
MethodCall @[1] {
desc="check the configuration of the network monitor -- will emit warnings and errors for misconfigurations";
flags=0;
code_string="trial_netmon->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="trial_netmon->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_netmon"]$;
method=taBase::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
MethodCall @[2] {
desc="update the monitor items and data schema based on current settings of the NetMonitor object";
flags=0;
code_string="trial_netmon->UpdateMonitors(true)";
pre_compile_code_string="trial_netmon->UpdateMonitors(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_netmon"]$;
method=NetMonitor::UpdateMonitors;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_first";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void UpdateMonitors(bool reset_first = false)";
meth_desc=" old name for UpdateDataTable";
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="add a new blank row to the data";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="trial_mon_data->AddBlankRow()";
pre_compile_code_string="trial_mon_data->AddBlankRow()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_mon_data"]$$;
method=DataTable::AddBlankRow;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="int AddBlankRow()";
meth_desc=" add a new row to the data table, sets read (source) and write (sink) index to this last row (as in ReadItem or WriteItem), so that subsequent data routines refer to this new row, and returns row ";
};
MethodCall @[1] {
desc="get the new monitor data from the network and other sources -- this does the main work";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="trial_netmon->GetMonVals()";
pre_compile_code_string="trial_netmon->GetMonVals()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_netmon"]$;
method=NetMonitor::GetMonVals;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void GetMonVals()";
meth_desc=" get all the values and store in current row of data table -- call in program to get new data";
};
MethodCall @[2] {
desc="update views and other things after writing new data to monitor data table";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="trial_mon_data->WriteClose()";
pre_compile_code_string="trial_mon_data->WriteClose()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].vars["trial_mon_data"]$;
method=DataTable::WriteClose;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void WriteClose()";
meth_desc=" closes up a write operation -- call when done writing data -- performs any post-writing cleanup/closing of files, etc";
};
MethodCall @[3] {
desc="only functional for dmem projects: synchronizes trial data across processes so that all distributed memory processors have the same trial-level data, despite having run only a subset of them each";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="network->DMem_ShareTrialData(trial_mon_data, 1)";
pre_compile_code_string="network->DMem_ShareTrialData(trial_mon_data, 1)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraTrialMonitor"].args["network"]$$;
method=Network::DMem_ShareTrialData;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="trial_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="n_rows";
required=0;
def_val="1";
prev_expr=;
expr {
expr="1";
};
};
};
meth_sig="void DMem_ShareTrialData(DataTable* dt, int n_rows = 1)";
meth_desc=" share trial data from given datatable across the trial-level dmem communicator (outer loop) -- each processor gets data from all other processors; if called every trial with n_rows = 1, data will be identical to non-dmem; if called at end of epoch with n_rows = -1 data will be grouped by processor but this is more efficient";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["Cycle_Monitor"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].doc$$;
};
};
name="Cycle_Monitor";
short_nm="Monitor";
tags=;
desc="monitor trial-level data from the network (and potentially other sources) -- stores results in datatable (TrialOutputData typically) that can be used for graph/grid views and further analysis ";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=NetMonitor;
el_def=0;
NetMonitor @["cycle_netmon"] {
name="cycle_netmon";
items {
name="items";
el_typ=NetMonItem;
el_def=0;
NetMonItem @["batch"] {
name="batch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="batch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["epoch"] {
name="epoch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="epoch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["trial"] {
name="trial";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="trial";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["trial_name"] {
name="trial_name";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="trial_name";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["group_name"] {
name="group_name";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="group_name";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["phase_no"] {
name="phase_no";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="phase_no";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["cycle"] {
name="cycle";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="cycle";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["sse"] {
name="sse";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="sse";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["ext_rew"] {
name="ext_rew";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=NULL;
variable="ext_rew";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["STN_acts_avg"] {
name="STN_acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["Motor__acts_avg"] {
name="Motor__acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["Thalam_acts_avg"] {
name="Thalam_acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["GP_Int_acts_avg"] {
name="GP_Int_acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["GP_Ext_acts_avg"] {
name="GP_Ext_acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["Output_act"] {
name="Output_act";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="act";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["Output_units_0_act"] {
name="Output_units_0_act";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="units[0].act";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["SNc_acts_avg"] {
name="SNc_acts_avg";
computed=0;
object_type=LeabraLayer;
object=NULL;
variable="acts.avg";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
};
network=NULL;
data=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["CycleOutputData"]$$;
rmv_orphan_cols=1;
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=NULL;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to record data from";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["cycle_mon_data"] {
name="cycle_mon_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["CycleOutputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="data table to record trial-level data to (this program writes new data to this table!)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["cycle_netmon"] {
name="cycle_netmon";
var_type=T_Object;
object_type=NetMonitor;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].objs["cycle_netmon"]$$;
objs_ptr=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="pointer to the NetMonitor object in objs secton of this program that contains configuration for what to record and where to get it";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="set the network and datatable for the NetMonitor";
flags=0;
code_string="cycle_netmon->SetDataNetwork(cycle_mon_data, network)";
pre_compile_code_string="cycle_netmon->SetDataNetwork(cycle_mon_data, network)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_netmon"]$$;
method=NetMonitor::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="cycle_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* dt, Network* net)";
meth_desc=" set both the data table and network -- convenient for programs -- calls ResetDataTableCols too -- don't call if columns are manually added or this is adding additional rows to a table";
};
MethodCall @[1] {
desc="check the configuration of the network monitor -- will emit warnings and errors for misconfigurations";
flags=0;
code_string="cycle_netmon->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="cycle_netmon->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_netmon"]$;
method=taBase::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
MethodCall @[2] {
desc="update the monitor items and data schema based on current settings of the NetMonitor object";
flags=0;
code_string="cycle_netmon->UpdateMonitors(true)";
pre_compile_code_string="cycle_netmon->UpdateMonitors(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_netmon"]$;
method=NetMonitor::UpdateMonitors;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_first";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void UpdateMonitors(bool reset_first = false)";
meth_desc=" old name for UpdateDataTable";
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
IfReturn @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if(network.phase_no>0) return";
pre_compile_code_string="if(network.phase_no>0) return";
cond {
expr="network.phase_no>0";
};
};
MethodCall @[1] {
desc="add a new blank row to the data";
flags=0;
code_string="cycle_mon_data->AddBlankRow()";
pre_compile_code_string="cycle_mon_data->AddBlankRow()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_mon_data"]$$;
method=DataTable::AddBlankRow;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="int AddBlankRow()";
meth_desc=" add a new row to the data table, sets read (source) and write (sink) index to this last row (as in ReadItem or WriteItem), so that subsequent data routines refer to this new row, and returns row ";
};
MethodCall @[2] {
desc="get the new monitor data from the network and other sources -- this does the main work";
flags=0;
code_string="cycle_netmon->GetMonVals()";
pre_compile_code_string="cycle_netmon->GetMonVals()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_netmon"]$;
method=NetMonitor::GetMonVals;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void GetMonVals()";
meth_desc=" get all the values and store in current row of data table -- call in program to get new data";
};
MethodCall @[3] {
desc="update views and other things after writing new data to monitor data table";
flags=0;
code_string="cycle_mon_data->WriteClose()";
pre_compile_code_string="cycle_mon_data->WriteClose()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].vars["cycle_mon_data"]$;
method=DataTable::WriteClose;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void WriteClose()";
meth_desc=" closes up a write operation -- call when done writing data -- performs any post-writing cleanup/closing of files, etc";
};
MethodCall @[4] {
desc="only functional for dmem projects: synchronizes trial data across processes so that all distributed memory processors have the same trial-level data, despite having run only a subset of them each";
flags=0;
code_string="network->DMem_ShareTrialData(cycle_mon_data, 1)";
pre_compile_code_string="network->DMem_ShareTrialData(cycle_mon_data, 1)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["Cycle_Monitor"].args["network"]$$;
method=Network::DMem_ShareTrialData;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="cycle_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="n_rows";
required=0;
def_val="1";
prev_expr=;
expr {
expr="1";
};
};
};
meth_sig="void DMem_ShareTrialData(DataTable* dt, int n_rows = 1)";
meth_desc=" share trial data from given datatable across the trial-level dmem communicator (outer loop) -- each processor gets data from all other processors; if called every trial with n_rows = 1, data will be identical to non-dmem; if called at end of epoch with n_rows = -1 data will be grouped by processor but this is more efficient";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraEpochMonitor"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].doc$$;
};
};
name="LeabraEpochMonitor";
short_nm="EpcMon";
tags="Leabra, Std, Monitor";
desc="monitor epoch-level data from the network to a datatable (EpochOutputData typically) for use in graphing and viewing and further analysis";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=NetMonitor;
el_def=0;
NetMonitor @["epoch_netmon"] {
name="epoch_netmon";
items {
name="items";
el_typ=NetMonItem;
el_def=0;
NetMonItem @["batch"] {
name="batch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="batch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["epoch"] {
name="epoch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="epoch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_sse"] {
name="avg_sse";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_sse";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["cnt_err"] {
name="cnt_err";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="cnt_err";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_ext_rew"] {
name="avg_ext_rew";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_ext_rew";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_cycles"] {
name="avg_cycles";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_cycles";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
};
network=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
data=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["EpochOutputData"]$$;
rmv_orphan_cols=1;
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to get data from";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["epoch_mon_data"] {
name="epoch_mon_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["EpochOutputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="data table to write the epoch data to";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_netmon"] {
name="epoch_netmon";
var_type=T_Object;
object_type=NetMonitor;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].objs["epoch_netmon"]$$;
objs_ptr=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="network monitor object that contains full specs for what to record and where to get it";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_timer"] {
name="epoch_timer";
var_type=T_Object;
object_type=TimeUsed;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].epoch_time$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="pointer to the network's epoch-level timer, to record how long it took to process an epoch";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="get the epoch timer from current network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_timer"]$$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
MethodCall @[1] {
desc="set data and network on NetMonitor object";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->SetDataNetwork(epoch_mon_data, network)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->SetDataNetwork(epoch_mon_data, network)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_netmon"]$$;
method=NetMonitor::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="epoch_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* dt, Network* net)";
meth_desc=" set both the data table and network -- convenient for programs -- calls ResetDataTableCols too -- don't call if columns are manually added or this is adding additional rows to a table";
};
MethodCall @[2] {
desc="check configuration and emit errors/warnings for problems";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_netmon"]$;
method=taBase::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
MethodCall @[3] {
desc="update the monitor items and data schema based on current settings of NetMonitor";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->UpdateMonitors(true)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->UpdateMonitors(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_netmon"]$;
method=NetMonitor::UpdateMonitors;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_first";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void UpdateMonitors(bool reset_first = false)";
meth_desc=" old name for UpdateDataTable";
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="add a new blank row to the data";
flags=0;
code_string="epoch_mon_data->AddBlankRow()";
pre_compile_code_string="epoch_mon_data->AddBlankRow()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_mon_data"]$$;
method=DataTable::AddBlankRow;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="int AddBlankRow()";
meth_desc=" add a new row to the data table, sets read (source) and write (sink) index to this last row (as in ReadItem or WriteItem), so that subsequent data routines refer to this new row, and returns row ";
};
MethodCall @[1] {
desc="get the new monitor data and stor it into the data table -- this does the main job here";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->GetMonVals()";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->GetMonVals()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_netmon"]$;
method=NetMonitor::GetMonVals;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void GetMonVals()";
meth_desc=" get all the values and store in current row of data table -- call in program to get new data";
};
AssignExpr @[2] {
desc="get the epoch timer from current network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_timer"]$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
MethodCall @[3] {
desc="update after writing new data to monitor data table";
flags=0;
code_string="epoch_mon_data->WriteClose()";
pre_compile_code_string="epoch_mon_data->WriteClose()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor"].vars["epoch_mon_data"]$;
method=DataTable::WriteClose;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void WriteClose()";
meth_desc=" closes up a write operation -- call when done writing data -- performs any post-writing cleanup/closing of files, etc";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["LeabraEpochMonitor_10"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].doc$$;
};
};
name="LeabraEpochMonitor_10";
short_nm="pcMntF";
tags="Leabra, Std, Monitor";
desc="monitor epoch-level data from the network to a datatable (EpochOutputData typically) for use in graphing and viewing and further analysis";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=NetMonitor;
el_def=0;
NetMonitor @["epoch_netmon"] {
name="epoch_netmon";
items {
name="items";
el_typ=NetMonItem;
el_def=0;
NetMonItem @["batch"] {
name="batch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="batch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["epoch"] {
name="epoch";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="epoch";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_sse"] {
name="avg_sse";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_sse";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["cnt_err"] {
name="cnt_err";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="cnt_err";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_ext_rew"] {
name="avg_ext_rew";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_ext_rew";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
NetMonItem @["avg_cycles"] {
name="avg_cycles";
computed=0;
object_type=LeabraNetwork;
object=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
variable="avg_cycles";
var_label=;
name_style=AUTO_NAME;
max_name_len=6;
val_type=VT_FLOAT;
matrix=0;
matrix_geom{ };
data_agg=0;
data_src=NULL;
agg_col {
col_name=;
};
agg {name="agg": op=NONE: rel={name="rel": rel=LESSTHANOREQUAL: val=0: val_string="": use_var=0: var=NULL: }: };
select_rows=0;
select_spec {
col_name=;
name="_EQUAL_";
on=1;
rel=EQUAL;
use_var=0;
cmp 0 1;
var=NULL;
enable_var=NULL;
};
pre_proc_1 {name="pre_proc_1": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_2 {name="pre_proc_2": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
pre_proc_3 {name="pre_proc_3": opr=NONE: arg=0: lw=-1: hi=1: };
};
};
network=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
data=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["EpochOutputData"]$;
rmv_orphan_cols=1;
};
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to get data from";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["FlatNetwork"] {
name="FlatNetwork";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to operate on -- updates batch counter on network and passes it to train program";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["epoch_mon_data"] {
name="epoch_mon_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["OutputData"]["EpochOutputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="data table to write the epoch data to";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_netmon"] {
name="epoch_netmon";
var_type=T_Object;
object_type=NetMonitor;
object_val=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].objs["epoch_netmon"]$$;
objs_ptr=1;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="network monitor object that contains full specs for what to record and where to get it";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_timer"] {
name="epoch_timer";
var_type=T_Object;
object_type=TimeUsed;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].epoch_time$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="pointer to the network's epoch-level timer, to record how long it took to process an epoch";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="get the epoch timer from current network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_timer"]$$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
MethodCall @[1] {
desc="set data and network on NetMonitor object";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->SetDataNetwork(epoch_mon_data, network)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->SetDataNetwork(epoch_mon_data, network)";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_netmon"]$$;
method=NetMonitor::SetDataNetwork;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=DataTable_ptr;
type="DataTable*";
name="dt";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="epoch_mon_data";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network_ptr;
type="Network*";
name="net";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network";
};
};
};
meth_sig="void SetDataNetwork(DataTable* dt, Network* net)";
meth_desc=" set both the data table and network -- convenient for programs -- calls ResetDataTableCols too -- don't call if columns are manually added or this is adding additional rows to a table";
};
MethodCall @[2] {
desc="check configuration and emit errors/warnings for problems";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->CheckConfig(false)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->CheckConfig(false)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_netmon"]$;
method=taBase::CheckConfig;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="quiet";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="bool CheckConfig(bool quiet = false)";
meth_desc=" check the configuration of this object and all its children (defaults to no confirm of success)";
};
MethodCall @[3] {
desc="update the monitor items and data schema based on current settings of NetMonitor";
flags=0;
code_string="epoch_netmon->UpdateMonitors(true)";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->UpdateMonitors(true)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_netmon"]$;
method=NetMonitor::UpdateMonitors;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="reset_first";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="true";
};
};
};
meth_sig="void UpdateMonitors(bool reset_first = false)";
meth_desc=" old name for UpdateDataTable";
};
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MethodCall @[0] {
desc="add a new blank row to the data";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_mon_data->AddBlankRow()";
pre_compile_code_string="epoch_mon_data->AddBlankRow()";
result_var=NULL;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_mon_data"]$$;
method=DataTable::AddBlankRow;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="int AddBlankRow()";
meth_desc=" add a new row to the data table, sets read (source) and write (sink) index to this last row (as in ReadItem or WriteItem), so that subsequent data routines refer to this new row, and returns row ";
};
MethodCall @[1] {
desc="get the new monitor data and stor it into the data table -- this does the main job here";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_netmon->GetMonVals()";
pre_compile_code_string="epoch_netmon->GetMonVals()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_netmon"]$;
method=NetMonitor::GetMonVals;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void GetMonVals()";
meth_desc=" get all the values and store in current row of data table -- call in program to get new data";
};
AssignExpr @[2] {
desc="get the epoch timer from current network";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
pre_compile_code_string="epoch_timer = network.epoch_time";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_timer"]$;
expr {
expr="network.epoch_time";
};
};
MethodCall @[3] {
desc="update after writing new data to monitor data table";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="epoch_mon_data->WriteClose()";
pre_compile_code_string="epoch_mon_data->WriteClose()";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["LeabraEpochMonitor_10"].vars["epoch_mon_data"]$;
method=DataTable::WriteClose;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
};
meth_sig="void WriteClose()";
meth_desc=" closes up a write operation -- call when done writing data -- performs any post-writing cleanup/closing of files, etc";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["SaveWeights"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].doc$$;
};
};
name="SaveWeights";
short_nm="SvWts";
tags="Network, Weights";
desc="save network's current weight values to file using WriteWeights function, with file name based on project name + batch + epoch values";
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=NO_STOP_STEP;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=Network;
object_val=NULL;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["tag"] {
name="tag";
var_type=T_String;
string_val=;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="user-provided tag (startup script will set this!)";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["wts_subdir"] {
name="wts_subdir";
var_type=T_String;
string_val=;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="user-provided subdirectory to save weights in";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["fname"] {
name="fname";
var_type=T_String;
string_val=;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="final generated file name -- do not edit!";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["epoch_str"] {
name="epoch_str";
var_type=T_String;
string_val="0036";
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="string rep of epoch with leading zeros";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["batch_str"] {
name="batch_str";
var_type=T_String;
string_val="03";
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="string rep of batch with leading zeros";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["final_tag"] {
name="final_tag";
var_type=T_String;
string_val=".03_0036";
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="batch + epoch";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
IfReturn @[0] {
desc="do not save if not the first dmem process (only relevant for dmem = distributed memory processing)";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if(taMisc::dmem_proc > 0) return";
pre_compile_code_string="if(taMisc::dmem_proc > 0) return";
cond {
expr="taMisc::dmem_proc > 0";
};
};
MiscCall @[1] {
desc="get current batch counter for file name, with leading zeros to length 3";
flags=0;
code_string="batch_str = taMisc::LeadingZeros(network.batch, 2)";
pre_compile_code_string="batch_str = taMisc::LeadingZeros(network.batch, 2)";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].vars["batch_str"]$$;
object_type=taMisc;
method=taMisc::LeadingZeros;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=int;
type="int";
name="num";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network.batch";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="len";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="2";
};
};
};
};
MiscCall @[2] {
desc="get current epoch counter with leading zeros to length 4";
flags=0;
code_string="epoch_str = taMisc::LeadingZeros(network.epoch, 4)";
pre_compile_code_string="epoch_str = taMisc::LeadingZeros(network.epoch, 4)";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].vars["epoch_str"]$$;
object_type=taMisc;
method=taMisc::LeadingZeros;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=int;
type="int";
name="num";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="network.epoch";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=int;
type="int";
name="len";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="4";
};
};
};
};
AssignExpr @[3] {
desc="string 'tag' to identify the batch, epoch, and other user id info for the weights";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="final_tag = tag + \".\" + batch_str + \"_\" + epoch_str";
pre_compile_code_string="final_tag = tag + \".\" + batch_str + \"_\" + epoch_str";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].vars["final_tag"]$$;
expr {
expr="tag + \".\" + batch_str + \"_\" + epoch_str";
};
};
MethodCall @[4] {
desc="get a file name based on the project's current file name, for saving the weights";
flags=0;
code_string="fname = network->GetFileNameFmProject(\".wts.gz\", final_tag, wts_subdir, false)";
pre_compile_code_string="fname = network->GetFileNameFmProject(\".wts.gz\", final_tag, wts_subdir, false)";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].vars["fname"]$$;
obj=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].args["network"]$$;
method=taBase::GetFileNameFmProject;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=const_taString_ref;
type="taString&";
name="ext";
required=1;
def_val=;
prev_expr=;
expr {
expr="\".wts.gz\"";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=const_taString_ref;
type="taString&";
name="tag";
required=0;
def_val="\"\"";
prev_expr=;
expr {
expr="final_tag";
};
};
ProgArg @[2] {
arg_type=const_taString_ref;
type="taString&";
name="subdir";
required=0;
def_val="\"\"";
prev_expr=;
expr {
expr="wts_subdir";
};
};
ProgArg @[3] {
arg_type=bool;
type="bool";
name="dmem_proc_no";
required=0;
def_val="false";
prev_expr=;
expr {
expr="false";
};
};
};
meth_sig="taString GetFileNameFmProject(taString& ext, taString& tag, taString& subdir, bool dmem_proc_no = false)";
meth_desc=" get file name from project file name -- useful for saving files associated with the project; ext = extension; tag = additional tag; subdir = additional directory after any existing in project name; fname = proj->base_name (subdir) + tag + ext; if dmem_proc_no, add dmem proc no to file name. empty if project not found";
};
MethodCall @[5] {
desc="save the weights to that file name";
flags=0;
code_string="network->SaveWeights(fname, Network::NET_FMT)";
pre_compile_code_string="network->SaveWeights(fname, Network::NET_FMT)";
result_var=NULL;
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["SaveWeights"].args["network"]$;
method=Network::SaveWeights;
meth_args {
name=;
el_typ=ProgArg;
el_def=0;
ProgArg @[0] {
arg_type=const_taString_ref;
type="taString&";
name="fname";
required=0;
def_val="\"\"";
prev_expr=;
expr {
expr="fname";
};
};
ProgArg @[1] {
arg_type=Network::WtSaveFormat;
type="Network::WtSaveFormat";
name="fmt";
required=0;
def_val="Network::NET_FMT";
prev_expr=;
expr {
expr="Network::NET_FMT";
};
};
};
meth_sig="void SaveWeights(taString& fname, Network::WtSaveFormat fmt = NET_FMT)";
meth_desc=" write weight values out in a simple ordered list of weights (optionally in binary fmt) (leave fname empty to pull up file chooser)";
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
Program @["DA_Rew_Punish"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserData_DocLink;
el_def=0;
UserData_DocLink @["DocLink"] {
name="DocLink";
doc=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].doc$$;
};
};
name="DA_Rew_Punish";
short_nm="Punish";
tags=;
desc=;
version {
major=0;
minor=0;
step=0;
};
author=;
email=;
flags=0;
stop_step_cond {
expr=;
};
objs {
name="objs";
el_typ=taNBase;
el_def=0;
};
types {
name="types";
el_typ=DynEnumType;
el_def=0;
};
args {
name="args";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["network"] {
name="network";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraNetwork;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="network to train";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["input_data"] {
name="input_data";
var_type=T_Object;
object_type=DataTable;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].data.gp["InputData"]["TransferInputData"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL|PGRM_ARG;
reference=0;
desc="datatable with training patterns";
init_from=NULL;
};
};
vars {
name="vars";
el_typ=ProgVar;
el_def=0;
ProgVar @["num_intact_snc_units"] {
name="num_intact_snc_units";
var_type=T_Int;
int_val=2;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["snc_size"] {
name="snc_size";
var_type=T_Int;
int_val=4;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["k"] {
name="k";
var_type=T_Real;
real_val=0.5;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["sse"] {
name="sse";
var_type=T_Real;
real_val=1.253412008285522;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["bias"] {
name="bias";
var_type=T_Real;
real_val=3;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["act0"] {
name="act0";
var_type=T_Real;
real_val=0.9166443943977356;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["act1"] {
name="act1";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM0"] {
name="actM0";
var_type=T_Real;
real_val=0.2063146531581879;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM1"] {
name="actM1";
var_type=T_Real;
real_val=0.3712536096572876;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM2"] {
name="actM2";
var_type=T_Real;
real_val=0.8220142722129822;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM3"] {
name="actM3";
var_type=T_Real;
real_val=0.821648895740509;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM4"] {
name="actM4";
var_type=T_Real;
real_val=0.3602676391601562;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM5"] {
name="actM5";
var_type=T_Real;
real_val=0.1298051476478577;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM6"] {
name="actM6";
var_type=T_Real;
real_val=0.8131102323532104;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["actM7"] {
name="actM7";
var_type=T_Real;
real_val=0.7972568273544312;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["SNc"] {
name="SNc";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["SNc"]$;
objs_ptr=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Output"] {
name="Output";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["Output"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["Motor_Cortex"] {
name="Motor_Cortex";
var_type=T_Object;
object_type=LeabraLayer;
object_val=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"].layers["PMC"]$;
objs_ptr=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["i"] {
name="i";
var_type=T_Int;
int_val=2;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["TS"] {
name="TS";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["action"] {
name="action";
var_type=T_Int;
int_val=3;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["tonic_DA"] {
name="tonic_DA";
var_type=T_Real;
real_val=0.026;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["op_sse"] {
name="op_sse";
var_type=T_Int;
int_val=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["DA_dip_val"] {
name="DA_dip_val";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["DA_burst_val"] {
name="DA_burst_val";
var_type=T_Real;
real_val=1;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|USED|EDIT_VAL;
reference=0;
desc=;
init_from=NULL;
};
ProgVar @["biasValue"] {
name="biasValue";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="maximum number of epochs to run";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["biasInHid"] {
name="biasInHid";
var_type=T_Real;
real_val=0;
flags=NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="maximum number of epochs to run";
init_from=NULL;
};
ProgVar @["cycle"] {
name="cycle";
var_type=T_Int;
int_val=50;
flags=CTRL_PANEL|NULL_CHECK|SAVE_VAL|EDIT_VAL;
reference=0;
desc="current cycle of settling (local loop counter)";
init_from=NULL;
};
};
functions {
name="functions";
el_typ=Function;
el_def=0;
};
init_code {
name="init_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
};
prog_code {
name="prog_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc = network.layers.SNc";
pre_compile_code_string="SNc = network.layers.SNc";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$$;
expr {
expr="network.layers.SNc";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex = network.layers.PMC";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex = network.layers.PMC";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$$;
expr {
expr="network.layers.PMC";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Output = network.layers.Output";
pre_compile_code_string="Output = network.layers.Output";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Output"]$$;
expr {
expr="network.layers.Output";
};
};
AssignExpr @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="snc_size = SNc.units.size";
pre_compile_code_string="snc_size = SNc.units.size";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["snc_size"]$$;
expr {
expr="SNc.units.size";
};
};
AssignExpr @[4] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="k = (float)num_intact_snc_units/ snc_size";
pre_compile_code_string="k = (float)num_intact_snc_units/ snc_size";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["k"]$$;
expr {
expr="(float)num_intact_snc_units/ snc_size";
};
};
AssignExpr @[5] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="sse = network.sse";
pre_compile_code_string="sse = network.sse";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["sse"]$$;
expr {
expr="network.sse";
};
};
If @[6] {
desc="apply phasic DA in plus phase";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
pre_compile_code_string="if (network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE)";
cond {
expr="network.phase==LeabraNetwork::PLUS_PHASE";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
AssignExpr @[0] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM0 = Motor_Cortex.units[0].act_m";
pre_compile_code_string="actM0 = Motor_Cortex.units[0].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM0"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[0].act_m";
};
};
AssignExpr @[1] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM1 = Motor_Cortex.units[1].act_m";
pre_compile_code_string="actM1 = Motor_Cortex.units[1].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM1"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[1].act_m";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM2 = Motor_Cortex.units[2].act_m";
pre_compile_code_string="actM2 = Motor_Cortex.units[2].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM2"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[2].act_m";
};
};
AssignExpr @[3] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM3 = Motor_Cortex.units[3].act_m";
pre_compile_code_string="actM3 = Motor_Cortex.units[3].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM3"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[3].act_m";
};
};
AssignExpr @[4] {
desc="store minus phase activation of motor ctx unit 0";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM4 = Motor_Cortex.units[4].act_m";
pre_compile_code_string="actM4 = Motor_Cortex.units[4].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM4"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[4].act_m";
};
};
AssignExpr @[5] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM5 = Motor_Cortex.units[5].act_m";
pre_compile_code_string="actM5 = Motor_Cortex.units[5].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM5"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[5].act_m";
};
};
AssignExpr @[6] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM6 = Motor_Cortex.units[6].act_m";
pre_compile_code_string="actM6 = Motor_Cortex.units[6].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM6"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[6].act_m";
};
};
AssignExpr @[7] {
desc="store minus phase act of motor unit 1";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="actM7 = Motor_Cortex.units[7].act_m";
pre_compile_code_string="actM7 = Motor_Cortex.units[7].act_m";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["actM7"]$$;
expr {
expr="Motor_Cortex.units[7].act_m";
};
};
MemberAssign @[8] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[0].ext = actM0";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[0].ext = actM0";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[0].ext";
expr {
expr="actM0";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[9] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[1].ext = actM1";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[1].ext = actM1";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[1].ext";
expr {
expr="actM1";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[10] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[2].ext = actM2";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[2].ext = actM2";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[2].ext";
expr {
expr="actM2";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[11] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[3].ext = actM3";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[3].ext = actM3";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[3].ext";
expr {
expr="actM3";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[12] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[4].ext = actM4";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[4].ext = actM4";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[4].ext";
expr {
expr="actM4";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[13] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[5].ext = actM5";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[5].ext = actM5";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[5].ext";
expr {
expr="actM5";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[14] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[6].ext = actM6";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[6].ext = actM6";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[6].ext";
expr {
expr="actM6";
};
update_after=0;
};
MemberAssign @[15] {
desc="set plus phase acts to reflect minus phase response";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex.units[7].ext = actM7";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex.units[7].ext = actM7";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["Motor_Cortex"]$;
path="units[7].ext";
expr {
expr="actM7";
};
update_after=0;
};
ForLoop @[16] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < 8; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < 8; i++)";
loop_code {
name="ProgEl_List_189";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
};
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < 8";
};
iter {
expr="i++";
};
};
AssignExpr @[17] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 0";
pre_compile_code_string="action = 0";
result_var=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["action"]$$;
expr {
expr="0";
};
};
If @[18] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Output.acts.max >0)";
pre_compile_code_string="if (Output.acts.max >0)";
cond {
expr="Output.acts.max >0";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM0+actM4 > actM1+actM5) & ( actM0+actM4 > actM2+actM6) & ( actM0+actM4 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 1";
pre_compile_code_string="action = 1";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["action"]$;
expr {
expr="1";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM1+actM5 > actM0+actM4) & ( actM1+actM5 > actM2+actM6) & ( actM1+actM5 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 2";
pre_compile_code_string="action = 2";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["action"]$;
expr {
expr="2";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7))";
pre_compile_code_string="if (( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7))";
cond {
expr="( actM2+actM6 > actM0+actM4) & ( actM2+actM6 > actM1+actM5) & ( actM2+actM6 > actM3+actM7)";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 3";
pre_compile_code_string="action = 3";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["action"]$;
expr {
expr="3";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(10,0,\"wt\");";
};
};
AssignExpr @[2] {
desc="TS";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="action = 4";
pre_compile_code_string="action = 4";
result_var=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["action"]$;
expr {
expr="4";
};
};
};
};
};
};
};
};
};
};
If @[19] {
desc="if error is below threshold, given DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"8020\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"8020\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"8020\")";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (action==1)";
pre_compile_code_string="if (action==1)";
cond {
expr="action==1";
};
true_code {
name="ProgEl_List_170";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(10)>1)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(10)>1)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(10)>1";
};
true_code {
name="ProgEl_List_168";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set external input on SNC to high value for DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_burst_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_dip_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc="R2 = 80% neg, R3/R4 neutral";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (action==2)";
pre_compile_code_string="if (action==2)";
cond {
expr="action==2";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(10)>7)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(10)>7)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(10)>7";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set external input on SNC to high value for DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_burst_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_dip_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="tonic_DA";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
};
};
Else @[20] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc="R3 60 R4 40 R1/R2 neutral";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"6040\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"6040\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"6040\")";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (action==3)";
pre_compile_code_string="if (action==3)";
cond {
expr="action==3";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(10)>3)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(10)>3)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(10)>3";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set external input on SNC to high value for DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_burst_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_dip_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc="R2 = 80% neg, R3/R4 neutral";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (action==4)";
pre_compile_code_string="if (action==4)";
cond {
expr="action==4";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
If @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(10)>5)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(10)>5)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(10)>5";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set external input on SNC to high value for DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_burst_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_burst_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = DA_dip_val";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="DA_dip_val";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
Else @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="tonic_DA";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
};
};
};
};
};
};
};
Else @[7] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
ForLoop @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < 8; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < 8; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[i].bias.SetCnValName(0,0,\"wt\");";
};
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < 8";
};
iter {
expr="i++";
};
};
If @[1] {
desc="if error is below threshold, given DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"8020\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"8020\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"8020\")";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
If @[2] {
desc="if error is below threshold, given DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"6040\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"6040\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"6040\")";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
If @[3] {
desc="if error is below threshold, given DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"comboA\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"comboA\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"comboA\")";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[0].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[4].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
If @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(2)==0)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(2)==0)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(2)==0";
};
true_code {
name=;
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
Else @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
};
};
If @[4] {
desc="if error is below threshold, given DA burst";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (network.trial_name.contains(\"comboB\"))";
pre_compile_code_string="if (network.trial_name.contains(\"comboB\"))";
cond {
expr="network.trial_name.contains(\"comboB\")";
};
true_code {
name="true_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[1].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[5].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
If @[2] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="if (Random::IntZeroN(2)==0)";
pre_compile_code_string="if (Random::IntZeroN(2)==0)";
cond {
expr="Random::IntZeroN(2)==0";
};
true_code {
name="ProgEl_List_200";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[2].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[6].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
Else @[3] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="else";
pre_compile_code_string="else";
else_code {
name="else_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
CssExpr @[0] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[3].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
CssExpr @[1] {
desc=;
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
pre_compile_code_string="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
expr {
expr="Motor_Cortex->units[7].bias.SetCnValName(bias,0,\"wt\");";
};
};
};
};
};
};
ForLoop @[5] {
desc="loop over snc units";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
pre_compile_code_string="for (i = 0; i < k*snc_size; i++)";
loop_code {
name="loop_code";
el_typ=ProgCode;
el_def=0;
MemberAssign @[0] {
desc="set tonic DA val";
flags=CAN_REVERT_TO_CODE;
code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
pre_compile_code_string="SNc.units[i].ext = tonic_DA";
obj=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].programs.gp["LeabraAll_Std"]["DA_Rew_Punish"].vars["SNc"]$;
path="units[i].ext";
expr {
expr="tonic_DA";
};
update_after=0;
};
};
init {
expr="i = 0";
};
test {
expr="i < k*snc_size";
};
iter {
expr="i++";
};
};
};
};
};
step_prog=NULL;
step_n=1;
doc {
name="doc";
desc=;
web_doc=0;
wiki=;
url="local";
full_url="local";
text_size=1;
text=;
html_text=;
};
};
};
};
viewers {
name="viewers";
el_typ=MainWindowViewer;
el_def=0;
MainWindowViewer @["Browser"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_win_lft"] {
name="view_win_lft";
value 8 0=-0.04097222;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_win_top"] {
name="view_win_top";
value 8 0=0;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_win_wd"] {
name="view_win_wd";
value 8 0=1;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_win_ht"] {
name="view_win_ht";
value 8 0=0.7968561;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_win_iconified"] {
name="view_win_iconified";
value 1 0=0;
val_type_fixed=0;
};
UserDataItem @["view_splitter_state"] {
name="view_splitter_state";
value 9 0="AAAA/wAAAAEAAAADAAAAtwAAAmAAAAIuAQAAAAYBAAAAAQE=";
val_type_fixed=0;
};
};
name="Browser";
m_data=.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"]$$;
cur_font_size=12;
visible=1;
win_name=".projects[\"BG_4s_inhib_PS_e7a\"] - BG_4s_inhib_PS_e7a.proj";
m_is_root=0;
m_is_viewer_xor_browser=0;
m_is_proj_viewer=1;
m_is_dialog=0;
toolbars {
name="toolbars";
el_typ=ToolBar;
el_def=0;
ToolBar @["Application"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name=;
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_win_visible"] {
name="view_win_visible";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="Application";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
visible=0;
lft=0;
top=0;
o=Horizontal;
};
};
frames {
name="frames";
el_typ=BrowseViewerTaBase;
el_def=0;
BrowseViewerTaBase @["Navigator"] {
name="Navigator";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
visible=1;
root_typ=LeabraProject;
root_md=NULL;
m_root=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"]$;
};
PanelViewer @["Editor"] {
name="Editor";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
visible=1;
};
T3PanelViewer @["T3Frames"] {
UserDataItem_List @*(.user_data_) {
name="UserDataItem_List_78";
el_typ=UserDataItem;
el_def=0;
UserDataItem @["view_panel_selected"] {
name="view_panel_selected";
value 1 0=1;
val_type_fixed=0;
};
};
name="T3Frames";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
visible=1;
panels {
name="panels";
el_typ=T3Panel;
el_def=0;
T3Panel @["BGLoop1"] {
name="BGLoop1";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
visible=1;
root_view {
name="root_view";
m_data=NULL;
cur_font_size=12;
m_transform=NULL;
children {
name="children";
el_typ=NetView;
el_def=0;
NetView @["BG_4s_View"] {
name="BG_4s_View";
m_data=$.projects["BG_4s_inhib_PS_e7a"].networks["BG_4s"]$;
cur_font_size=12;
taTransform @*(.m_transform) {scale={x=1: y=1: z=1: }: rotate={x=1: y=0: z=0: rot=0.35: }: translate={x=0: y=0: z=0: }: };
main_xform {scale={x=1: y=1: z=1: }: rotate={x=1: y=0: z=0: rot=0.35: }: translate={x=0: y=0: z=0: }: };
annotations {
name="annotations";
el_typ=T3Annotation;
el_def=0;
};
annote_children {
name="annote_children";
el_typ=T3DataView;
el_def=0;
};
display=0;
lay_layout=THREE_D;
lay_mv=1;
net_text=1;
show_iconified=0;
net_text_xform {scale={x=0: y=0: z=0: }: rotate={x=1: y=0: z=0: rot=0: }: translate={x=0: y=-0.5: z=0: }: };
net_text_rot=0;
cur_unit_vals{ act; };
unit_src_path=".layers[1].units[4]";
con_type=ANY_CON;
hist_idx=0;
hist_save=1;
hist_max=100;
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unit_disp_mode=UDM_CYLINDER;
unit_text_disp=UTD_NONE;
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max_size2d {x=10: y=43: z=1: };
eff_max_size {x=40: y=9: z=2.333333: };
font_sizes {
net_name=0.05;
net_vals=0.05;
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};
view_params {
xy_square=0;
unit_spacing=0.05;
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};
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snap_bord_disp=0;
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scale {
name="scale";
chunks=133;
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max=1;
last_min=0;
last_max=0;
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zero=0;
spec=.colorspecs["C_ColdHot"]$$